×
13.01.2017
217.015.6b53

Результат интеллектуальной деятельности: РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pER-TB4GyrA-AcSer, КОДИРУЮЩАЯ СЕРИНОВУЮ АЦЕТИЛТРАНСФЕРАЗУ, СПОСОБНУЮ in vivo АЦЕТИЛИРОВАТЬ N-КОНЦЕВОЙ СЕРИН ДЕЗАЦЕТИЛТИМОЗИНА β4 И ГИБРИДНЫЙ БЕЛОК, СПОСОБНЫЙ К АВТОКАТАЛИТИЧЕСКОМУ РАСЩЕПЛЕНИЮ С ОБРАЗОВАНИЕМ ТИМОЗИНА β4 ЧЕЛОВЕКА, ШТАММ Eschrichia coli C3030/pER-TB4GyrA-AcSer - ПРОДУЦЕНТ УКАЗАННЫХ БЕЛКОВ И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ГЕННО-ИНЖЕНЕРНОГО ТИМОЗИНА β4 ЧЕЛОВЕКА

Вид РИД

Изобретение

Аннотация: Изобретение относится к области генной и белковой инженерии и представляет собой рекомбинантную плазмидную ДНК pER-TB4GyrA-AcSer, предназначенную для одновременного биосинтеза двух белков - гибридного полипептида, содержащего аминокислотную последовательность тимозина β4 человека и интеин, и фермента E. coli - сериновой ацетилтрансферазы. Плазмида имеет молекулярную массу 5,07 МДа и состоит из BsaBI/NdeI-фрагмента ДНК плазмиды pTWIN-1, содержащего последовательность промотора Т7 и оператора lacO; NdeI/PstI-фрагмента ДНК, содержащего последовательность гибридного белка, включающего в себя адаптированную к этим сайтам последовательность гена рекомбинантного человеческого тимозина β4, последовательность интеина Mxe GyrA и последовательность хитин-связывающего домена; PstI/NcoI-фрагмента ДНК, кодирующего ослабленную последовательность Шайна-Дальгарно и нестандартную в качестве старт кодона аминокислоту валин; NcoI/XhoI-фрагмента ДНК, содержащего последовательность сериновой N-ацетилтрансферазы; фрагмента ДНК, содержащего в качестве генетического маркера ген β-лактамазы, детерминирующий устойчивость трансформированных плазмидой pER-TA1GyrA-AcSer клеток E. coli к пенициллиновым антибиотикам; ДНК фрагмента, содержащего последовательность, кодирующую точку начала репликации; ДНК фрагмента, кодирующего последовательность лактозного репрессора LacI. Изобретение относится также к штамму Escherichia coli C3030/pER-TB4GyrA-AcSer, продуцирующему гибридный полипептид, содержащий аминокислотную последовательность тимозина β4 человека и интеин, а также сериновую ацетилтрансферазу, полученному путем трансформации клеток штамма Escherichia coli C3030 рекомбинантной плазмидной ДНК pER-TB4GyrA-AcSer. Изобретение позволяет получить рекомбинантный человеческий тимозин бета 4 с высоким выходом и по упрощенной технологии. 3 н.п. ф-лы, 2 ил., 3 пр.

Изобретение относится к биотехнологии, в частности к генной и белковой инженерии. Оно может быть использовано для получения рекомбинантного человеческого тимозина бета 4.

Тимозин бета 4 - это полипептид, вырабатываемый клетками тимусовой железы, который участвует в регуляции полимеризации актина, а также участвует в пролиферации, миграции и дифференциации клеток. Эти свойства тимозина бета 4 определяют его ценность в качестве медицинского препарата, особенно при лечении ишемической болезни сердца.

Тимозин бета 4 человека представляет собой 43-членный полипептид, ацетилированный по N-концевой α-аминогруппе (SEQ ID NO 2).

В мировой практике природный тимозин бета 4 получают химическим, а также микробиологическим способами. Альтернативным путем является биотехнологический способ получения тимозина бета 4 с использованием экспрессии рекомбинантного гена в бактериях.

Известны экспрессионные системы, обеспечивающие синтез тимозина β4 в составе гибридных белков с интеином Мхе GyrA (Li X., Zheng L., Peng F., Qi C., Zhang X., Zhou A., Liu Z., Wu S. Protein. Expr. Purif. 2007. V. 56. P. 229-236), а также аффинной группой из остатков гистидина (Но J.H., Chuang С.Н., Но C.Y., Shih Y.R., Lee O.K., Su Y. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 2007. V. 48. P. 27-33).

Недостаток метода заключается в том, что полученный рекомбинантный продукт в своем составе помимо последовательности тимозина β4 содержал дополнительные аминокислотные последовательности, что может ограничивать его применение в медицинской практике. Ко всему прочему, в вышеприведенных работах была получена не ацетилированная форма тимозина β4, которая образует более стабильный комплекс с глобулярным актином и частично теряет способность природного Тβ4 ингибировать полимеризацию актина (Zoubek R.E., Hannappel Е. Ann. N. Y. Acad. Sci. 2007. V. 1112. P. 435-441).

С целью избежать вышеописанных проблем была создана экспрессионная система, обеспечивающая синтез не ацетилированной формы тимозина β4 в составе гибридного белка, состоящего из тиоредоксина, остатков гистидина, сайта расщепления TEV-протеиназой и аминокислотной последовательности тимозина β4. Для отщепления не ацетилированной формы тимозина β4 из гибридного белка используют сайт-специфическую TEV-протеиназу и далее химическим путем осуществляют направленное ацетилирование по N-концевому Ser уксусным ангидридом (К.А. Бейрахова, В.Н. Степаненко, А.И. Мирошников, Р.С. Есипов Биоорганическая химия. 2011. 37 №2. С. 1-10).

Недостаток химического ацетилирования пептида заключался в образовании множества побочных продуктов реакции, что требовало дополнительной стадии очистки.

Прототип, наиболее близкий к заявленному для патентования способу получения тимозина β4, описан в работе (CAO Sai, DAI HongMei, SUN Xu, ZHUANSUN DanDan, HE JinZhou, SI XinXi, LI ShuLong, FANG HongQing, CHEN HuiPeng, XIE DaPing, ZHOU ChangLin Scientia Sinica Vitae. 2011. V. 41(10). P. 1008-1015). В данной работе ацилирование N-концевого серина тимозина бета 4 проводили in vivo ssArd1 - ацетилазой из экстремофила Sulfolobus solfataricus. Для этого в геномную ДНК штамма Е. coli BL21(DE3) интегрируют ssArd1 - интеграционную кассету в локус lpxM с помощью рекомбинации. Тимозин бета 4 синтезировался в составе гибридного белка с мини интеином Spl DnaX из Spirulina platensis.

Изобретение решает задачу получения высокопродуктивного рекомбинантного бактериального штамма-продуцента, позволяющего получать рекомбинантный человеческий тимозин β4 с высоким выходом и по упрощенной технологии.

Поставленная задача решается за счет того, что:

1. Конструируют экспрессионную плазмиду ДНК pER-TB4GyrA путем клонирования гена тимозина β4 в векторную плазмиду pTWIN1. Участок, кодирующий измененную последовательность Шайна-Дальгарно и нестандартную в качестве старт кодона аминокислоту валин, синтезируют из двух олигонуклеотидов и клонируют в вектор pER-TB4GyrA. Далее с помощью искусственно синтезированных олигонуклеотидов амплифицируют участок генома Escherichia coli, кодирующий сериновую ацетилтрансферазу, и клонируют в векторную плазмиду pER-TB4GyrA-RBS. Таким образом, получают вектор pER-TB4GyrA-AcSer.

2. Путем трансформации плазмидной ДНК pER-TB4GyrA-AcSer клеток Escherichia coli С3030 получают штамм-продуцент.

3. При индуцированном культивировании штамма-продуцента происходит биосинтез рекомбинантной сериновой ацетилтрансферазы и накопление in vivo ацетилированного по N-концевой α-аминогруппе растворимого гибридного белка TB4GyrA, содержащего наряду с тимозином бета 4 человека и последовательность мини-интеина Мхе Gir А.

4. Клеточную биомассу разрушают в буферном растворе и выделяют осветленный клеточный лизат, содержащий гибридный белок TB4GyrA. Гибридный белок TB4GyrA наносят на хитиновый сорбент, уравновешенный в буфере, содержащем 100 мМ NaCl, промывают буфером, содержащим 2 М мочевину, и уравновешивают в буфере, содержащем 100 мМ ДТТ, тем самым индуцируют автокаталитическое расщепление гибридного белка, и инкубируют 24 ч при 25°C. Отщепленный тимозин бета 4 затем элюируют в том же буфере. Дальнейшую очистку и анализ рекомбинантного тимозина β4 человека проводят посредством обращенно-фазовой хроматографии. Идентификацию образующегося рекомбинантного человеческого тимозина β4 проводят с помощью масс-спектрометрии.

Техническим результатом автокаталитического расщепления гибридного белка является образование тимозина β4, выход которого достигает 3% относительно суммарного белка клетки при чистоте препарата не ниже 98%.

Чтобы избежать трудностей, связанных с расщеплением рекомбинантного гибридного белка с помощью различных протеаз, таких как энтерокиназа, фактор X и др., а также с целью удешевления этой стадии используют в составе гибридного белка мини-интеин GyrA из Mycobacterium xenopi (Telenti, A., Southworth, М., Alcaide, F., Daugelat, S., Jacobs, W.R. Jr. and Perler, F.B. (1997). J. Bacteriol.. V 179, P. 6378-6382) для направленного автокаталитического расщепления гибрида на целевой полипептид и интеин. Для этой цели амплифицируют ген тимозина β4 (SEQ ID NO 1) с помощью ПЦР, используя в качестве матрицы плазмиду с искусственным геном тимозина β4, и клонируют его в векторную плазмиду pTWIN1, содержащую ген интеина из Mycobacterium xenopi GyrA, и участок связывания с хитином (Chitin-Binding Domen) из Bacillus circulans (Telenti, A., Southworth, M,, Alcaide, F., Daugelat, S., Jacobs, W.R. Jr. and Perler, F.B. (1997). J. Bacteriol.. 179, 6378-6382; Evans, J, T.C., Bermer, J., Xu, M.-Q., (1999) J. Biol. Chem., V 274, P. 18359-18363), по сайтам эндонуклеаз рестрикции NdeI и SapI. Далее для получения полицистронной конструкции участок, кодирующий измененную последовательность Шайна-Дальгарно и нестандартную в качестве старт кодона аминокислоту валин, синтезируют из двух олигонуклеоттидов и клонируют в вектор pTWIN1 по сайтам эндонуклеаз рестриции Pst I и Bam HI. Далее с помощью искусственно синтезированных олигонуклеотидов амплифицируют участок генома Escherichia coli, кодирующий сериновую ацетилтрансферазу, и клонируют в полученную до этого векторную плазмиду pER-TB4GyrA-RBS по сайтам эндонуклеаз рестрикции NcoI и XhoI. Полученной экспрессионной плазмидой pER-TB4GyrA-AcSer, строение которой приведено на фиг. 1, трансформируют клетки E. coli С3030.

Образующийся при экспрессии рекомбинантного гена гибридный белок TB4GyrA далее in vivo процессируется с отщеплением N-формилметионина и селективно ацетилируется по N-концевому серину. Этот гибридный белок способен к автокаталитическому расщеплению на тимозин β4 человека и интеин. Выход тимозина β4 высокой степени чистоты (98%) после обращенно-фазовой хроматографии достигает 3% относительно суммарного белка клетки.

В предлагаемом техническом решении используют штамм-продуцент Escherichia coli С3030, содержащий плазмидную ДНК pER-TB4GyrA-AcSer для суперпродукции и продукции двух белков: гибридного белка TB4GyrA, содержащего последовательность тимозина β4 человека и интеин Мхе GirA, и фермента - сериновой ацетилтрансферазы E. coli соответственно.

Используют рекомбинантную плазмидную ДНК pER-TB4GyrA-AcSer

- кодирующую аминокислотную последовательность рекомбинантного человеческого тимозина β4;

- состоящую из из BsaBI/NdeI-фрагмента ДНК плазмиды pTWIN-1, содержащего последовательность промотора Т7 и оператора lacO; NdeI/PstI-фрагмента ДНК, содержащего последовательность гибридного белка, включающего в себя адаптированную к этим сайтам последовательность гена рекомбинантного человеческого тимозина β4, последовательность интеина Мхе GyrA и последовательность хитинсвязывающего домена; PstI/NcoI-фрагмента ДНК, кодирующего ослабленную последовательность Шайна-Дальгарно и нестандартную в качестве старт кодона аминокислоту валин; NcoI/XhoI-фрагмента ДНК, содержащего последовательность сериновой N-ацетилтрансферазы;

- содержащая в качестве генетического маркера ген β-лактамазы, детерминирующий устойчивость трансформированных плазмидой pER-TB4GyrA-AcSer клеток E. coli к пенициллиновым антибиотикам; последовательность, кодирующую точку начала репликации; ДНК фрагмент, кодирующий последовательность лактозного репрессора LacI.

Конструкция рекомбинантной плазмидиой ДНК pER-TB4GyrA-AcSer обеспечивает высокий уровень экспрессии клонированного в ней гена гибридного белка TB4GyrA, содержащего на 5′-конце ген тимозина бета 4, соединенного с геном Мхе GyrA. Для конструирования плазмиды используют химический подход, позволяющий использовать для экспрессии клонированного структурного гена оптимальные регуляторные элементы, контролирующие его экспрессию.

Ген человеческого тимозина β4 получают амплификацией участка плазмиды pER-TEVrs-TB4 (, Stepanenko VN, Miroshnikov AI, Esipov RS (2011) Bioorg Khim. V 37 N. 2. P. 223-32).

Концевые его участки, содержащие соответствующие вектору сайты эндонуклеаз рестрикции, введены с помощью ПЦР с синтетическими олигонуклеотидными праймерами А1 и B1 (SEQ ID NO 3), и затем ген клонируют в векторную плазмиду pTWIN1.

Предлагаемый штамм-продуцент Escherichia coli C3030/pER-TB4GyrA-AcSer характеризуется следующими признаками:

Морфологические признаки. Клетки палочковидной формы, грамотрицательные, неспороносные.

Культуральные признаки. Клетки хорошо растут на простых питательных средах. При росте на агаре "Дифко" - колонии круглые, гладкие, мутные, блестящие серые, край ровный. При росте на жидких средах (на минимальной среде с глюкозой или LB-бульоне) образуют интенсивную ровную муть.

Физико-биологические признаки. Клетки растут при температуре от 4°C до 40°C при оптимуме pH от 6,8 до 7,5. В качестве источника азота используют как минеральные соли в аммонийной форме, так и органические соединения в виде пептона, триптона, дрожжевого экстракта, аминокислот и т.д. В качестве источника углерода используют аминокислоты, глицерин, углеводы.

Устойчивость к антибиотикам. Клетки проявляют устойчивость к пенициллиновым антибиотикам (до 500 мкг/мл).

Штамм-продуцент E. coli C3030/pER-TB4GyrA-AcSer отличается от штамма-реципиента E. coli C3030 только наличием рекомбинантной плазмидной ДНК pER-TB4GyrA-AcSer, которая и придает ему устойчивость к пенициллиновым антибиотикам.

Штаммы-продуценты получают путем трансформации компетентных клеток E. coli C3030 соответствующей рекомбинантной плазмидной ДНК.

Клетки E. coli C3030/pER-TB4GyrA-AcSer являются одновременно суперпродуцентом и продуцентом. При индукции изопропилтио-β-D-галактозидом происходит эффективный биосинтез гибридного белка TB4GyrA, который накапливается в клетках в количестве 23% суммарного белка клетки в растворимом виде. Продукция фермента составляет 6% по отношению к общим белкам клетки.

Изобретение осуществляют следующим образом. Конструируют рекомбинантную плазмидную ДНК pER-TB4GyrA-AcSer, для чего ген рекомбинантного человеческого тимозина β4 амплифицируют с помощью ПЦР с синтетическими олигонуклеотидными праймерами (SEQ ID NO 3), содержащими сайты эндонуклеаз рестрикции NdeI (N-конец гена, праймер А1) и SapI (С-конец гена, праймер В1), полученную ДНК расщепляют соответствующими рестриктазами и затем лигируют с расщепленной по тем же сайтам векторной плазмидой pTWIN1. Далее участок, кодирующий измененную последовательность Шайна-Дальгарно, нестандартную в качестве старт кодона аминокислоту валин и сайты эндонуклеаз рестриции PstI и BamHI, NcoI и XhoI (SEQ ID NO 6), синтезируют из двух олигонуклеотидов и клонируют в полученную плазмиду pER-TB4GyrA по сайтам эндонуклеаз рестрикции PstI и Bam H1. Ген сериновой ацетилтрансферазы получают амплификацией генома E. coli с помощью ПЦР с праймерами В3 и A3 (SEQ ID NO 5), содержащими сайты эндонуклеаз рестриции NcoI и XhoI. Полученную ДНК расщепляют соответствующими рестриктазами и затем лигируют с расщепленной по тем же сайтам плазмидой pER-TB4GyrA-RBS. Лигазной смесью трансформируют компетентные клетки E. coli C3030 и высевают на LB-агар, содержащий 50 мкг/мл ампициллина или другого пенициллинового антибиотика. Полученные клоны анализируют с помощью секвенирования.

Штамм-продуцент E. coli C3030/pER-TB4GyrA-AcSer выращивают в богатой среде (YT-, LB-бульон и др.) (или индуцируют изопропилтио-β-D-галактозидом и снова выращивают) до достижения максимальной плотности культуры.

На (SEQ ID NO 1) изображена структура гена рекомбинантного человеческого тимозина β4. На (SEQ ID NO 2) изображена аминокислотная последовательность рекомбинантного человеческого тимозина бета 4.

Изобретение иллюстрируется следующими чертежами.

Фиг 1. Физическая карта плазмиды pER-TB4GyrA-AcSer

Фиг 2. Электрофорграмма лизата клеток штамма-продуцента E. coli C3030/pER-TB4GyrA-AcSer

Изобретение иллюстрируется нижеследующими примерами.

Пример 1

Конструирование рекомбинантной плазмидной ДНК.

Химический синтез олигонуклеотидов выполняют твердофазным фосфоамидитным методом на ДНК-синтезаторе ASM-102U (БИОССЕТ, Новосибирск) с наращиванием олигонуклеотидной цепи в направлении от 3′-конца к 5′-концу с помощью защищенных фосфамидитов - 5′-диметокситритил-N-ацил-2′-дезоксинуклеозид-3′-O-(β-цианэтил-диизопропиламино)-фосфитов, активированных тетразолом. Синтез проводят в масштабе 0,5-0,7 мкмоль, используя в качестве носителя пористое стекло (размер пор 500 ), к которому через 3′-сукцинатную связь присоединяют первое нуклеозидное звено (нагрузка 20-30 мкмоль/г). Используют синтетический цикл стандартного фосфоамидитного метода.

Для приготовления вектора ДНК плазмиду pTWTN1 (3 мкг, 1 пмоль) обрабатывают в 40 мкл буфера Y (33 мМ трис-ацетат, pH 7,9, 10 мМ Mg-ацетат, 66 мМ К-ацетат 1, 0,5 мМ ДТТ, 0,1 мг/мл БСА) рестриктазой SapI (10 ед. акт.), а затем - в 40 мкл буфера О (50 мМ трис-HCl, pH 7,5, 10 мМ MgCl2, 100 мМ NaCl, 0,1 мг/мл БСА) рестриктазой NdeI (10 ед. акт.) в течение 1 ч при 37°C. Векторный фрагмент после электрофореза в 15% агарозном геле вырезают из геля и переносят в 200 мкл буфера NT, растворяют при 50°C в течение 5-10 мин и наносят на колонку NucleoSpin Extract II. Промывают буфером NT 3 и элюируют 50 мкл буфера NE.

Для приготовления гена тимозина бета 4 проводят амплификацию с помощью ПЦР, используя в качестве матрицы плазмиду с искусственным геном тимозина β4 (0,01 мкг в образце), а в качестве праймеров - синтетические олигонуклеотиды А1 и В1 (по 60 пмоль каждого). ПЦР проводят в ДНК-амплификаторе, в буферном растворе, состоящем каждый из четырех dNTP в концентрации 0,5 мМ и 5 ед. акт. Taq-ДНК-полимеразы, в следующем режиме: денатурация - 1 мин при 94°C, отжиг - 30 сек при 60°C, элонгация - 40 сек при 72°C, 30 циклов ПЦР. Ген после электрофореза в 15% агарозном геле вырезают из геля и переносят в 200 мкл буфера NT, растворяют при 50°C в течение 5-10 мин и наносят на колонку NucleoSpin Extract II. Промывают буфером NT 3 и элюируют 50 мкл буфера NE, затем расщепляют теми же рестриктазами, которые используют при приготовлении вектора, и выделяют целевой фрагмент из агарозного геля.

Полученный синтетический фрагмент с геном рекомбинантного человеческого тимозина β4 в количестве 2 пмоль прибавляют к раствору 1 мкг описанного выше векторного фрагмента в 10 мкл буфера (20 мМ трис-HCl, pH 7,56, 10 мМ MgCl2, 0,2 мМ рАТФ, 10 мМ дитиотреитол) и лигируют с помощью 10 ед. акт. Т4-ДНК-лигазы в течение 12 ч при 10°C.

ДНК, содержащую измененную последовательность Шайна-Дальгарно, а также сайты эндонуклеаз рестрикции получают из двух синтетических олигонуклеотидов А2 и В2 (SEQ ID NO 4). Олигонуклеотиды смешивают в эквимольном количестве (по 600 пмоль), денатурируют при 90°C и подвергают отжигу при медленном понижении температуры до 30°C.

Плазмиду pER-TB4GyrA (3 мкг, 1 пмоль) обрабатывают в 40 мкл буфера О (50 мМ трис-HCl, pH 7,5, 10 мМ MgCl2, 100 мМ NaCl, 0,1 мг/мл БСА) рестриктазой PstI (10 ед. акт.), а затем - в 40 мкл буфера R (10 мМ трис-HCl, pH 8,5, 10 мМ MgCl2, 100 мМ KCl, 0,1 мг/мл БСА) рестриктазой BamHI (10 ед. акт.) в течение 1 ч при 37°С. Векторный фрагмент после электрофореза в 15% агарозном геле вырезают из геля и переносят в 200 мкл буфера NT, растворяют при 50°C в течение 5-10 мин и наносят на колонку NucleoSpin Extract II. Промывают буфером NT 3 и элюируют 50 мкл буфера NE.

Полученный синтетический фрагмент с измененной последовательностью Шайна-Дальгарно (SEQ ID NO 6) в количестве 2 пмоль прибавляют к раствору 1 мкг описанного выше векторного фрагмента в 10 мкл буфера (20 мМ трис-HCl, pH 7,56, 10 мМ MgCl2, 0,2 мМ рАТФ, 10 мМ дитиотреитол) и лигируют с помощью 10 ед. акт. Т4-ДНК-лигазы в течение 12 ч при 10°C. В результате получается плазмида pER-TB4GyrA-RBS.

Плазмиду pER-TB4GyrA-RBS (3 мкг, 1 пмоль) обрабатывают в 40 мкл буфера Y (33 мМ трис-ацетат, pH 7,9, 10 мМ Mg-ацетат, 66 мМ К-ацетат 1, 0,5 мМ ДТТ, 0,1 мг/мл БСА) рестриктазой NcoI (10 ед. акт.), а затем - в 40 мкл буфера R (10 мМ трис-HCl, pH 8,5, 10 мМ MgCl2, 100 мМ KCl, 0,1 мг/мл БСА) рестриктазой XhoI (10 ед. акт.) в течение 1 ч при 37°C. Векторный фрагмент после электрофореза в 15% агарозном геле вырезают из геля и переносят в 200 мкл буфера NT, растворяют при 50°C в течение 5-10 мин и наносят на колонку NucleoSpin Extract II. Промывают буфером NT 3 и элюируют 50 мкл буфера NE.

Для приготовления гена сериновой ацетилтрансферазы проводят амплификацию с помощью ПЦР, используя в качестве матрицы геномную ДНК E. coli (0,01 мкг в образце), а в качестве праймеров - синтетические олигонуклеотиды A3 и В3 (по 60 пмоль каждого). ПЦР проводят в ДНК-амплификаторе, в буферном растворе, состоящем каждый из четырех dNTP в концентрации 0,5 мМ и 5 ед. акт. Taq-ДНК-полимеразы, в следующем режиме: денатурация - 1 мин при 94°C, отжиг - 30 сек при 60°C, элонгация - 40 сек при 72°C, 30 циклов ПЦР. Фрагмент длиной 564 п.о. после электрофореза в 15% агарозном геле вырезают из геля и переносят в 200 мкл буфера NT, растворяют при 50°C в течение 5-10 мин и наносят на колонку NucleoSpin Extract II. Промывают буфером NT 3 и элюируют 50 мкл буфера NE, затем расщепляют рестриктазами, которые используют при приготовлении вектора.

Полученный синтетический фрагмент с последовательностью сериновой ацетилтрансферазы в количестве 2 пмоль прибавляют к раствору 1 мкг описанного выше векторного фрагмента в 10 мкл буфера (20 мМ трис-HCl, pH 7,56, 10 мМ MgCl2, 0,2 мМ рАТФ, 10 мМ дитиотреитол) и лигируют с помощью 10 ед. акт. Т4-ДНК-лигазы в течение 12 ч при 10°C.

Аликвоту реакционной смеси используют для трансформации компетентных клеток E. coli C3030. Трансформанты высевают на чашки с LB-агаром, содержащим 50 мкг/мл ампициллина. Из клонов выделяют ДНК плазмиды pER-TB4GyrA-AcSer и анализируют с помощью эндонуклеаз NdeI, SapI, PstI, BamHI, NcoI и XhoI. Скрининг рекомбинантов проводят с помощью секвенирования. Физическая карта плазмиды pER-TB4GyrA-AcSer представлена на фиг. 1. Указаны сайты эндонуклеаз рестрикции. Ori - участок инициации репликации пзамиды. ApR - ген устойчивости к ампицилину. LacI - ген репрессора лактозного оперона. TB4GyrA - ген рекомбинантного белка, кодирующий тимозин бета 4 человека и интеин GyrA. SerAc - ген сериновой ацетилтрансферазы.

Пример 2

Получение штамма-продуцента E. coli C3030/pER-TB4GyrA-AcSer и определение его продуктивности

Штамм-продуцент E. coli C3030/pER-TB4GyrA-AcSer получают трансформацией компетентных клеток E. coli C3030 плазмидой pER-TB4GyrA-AcSer, как описано в примере 1. Клетки E. coli C3030, несущие плазмиду, структура которой подтверждена данными анализа (см. пример 1), являются продуцентами двух белков.

Штамм продуцента E. coli C3030/pER-TB4GyrA-AcSer выращивают при 37°C в 100 мл LB-бульона (pH 7,0) с 50 мкг/мл ампициллина в течение 2 ч на качалке со скоростью вращения 190 об/мин до мутности А550 0,7-0,8, прибавляют изопропилтио-β-D-галактозид до концентрации 0,2 мМ и продолжают процесс еще 6 ч, или продолжают выращивание в отсутствие индуктора в течение 6 ч. Каждый час отбирают пробу по 2 мл, определяют А550 и количество культуры, соответствующее 1 мл с А550 1,0, центрифугируют 5 мин при 6000 об/мин. Осажденные клетки в 100 мкл лизирующего буфера с красителем бромфеноловым синим обрабатывают 20 сек ультразвуком, нагревают 3 мин при 100°C и пробы по 4 мкл используют для электрофореза в 15% SDS-ПААГ. Гель прокрашивают кумасси R-250 по стандартной методике и сканируют с помощью денситометра Shimadzu CS-930. На фиг. 2 представлена электрофорграмма лизата клеток штамма-продуцента E. coli C3030/pER-TB4GyrA-AcSer, где М - стандарт молекулярных масс, L - лизат клеток, 1 - гибридный белок, содержащий тимозин бета 4, 2 - сериновая ацетилтрансфераза.

Пример 3

Получение гибридного белка TB4GyrA, его автокаталитическое расщепление и выделение рекомбинантного тимозина β4 человека

После окончания ферментации клетки продуцента гибридного белка TB4GyrA (биомассу) отделяют центрифугированием (5000 g, 20 мин, 4°C), разрушают на ультразвуковом дезинтеграторе в буфере (50 мМ Трис/HCl, 10 мМ ЭДТА, 1 мМ PMSF) и выделяют центрифугированием (15000 g, 45 мин) осветленный клеточный лизат. Наносят на хитиновый сорбент уравновешенный в буфере, содержащим 50 мМ Трис/HCl, 100 мМ NaCl, промывают буфером, содержащем 50 мМ Трис/HCl, 100 мМ NaCl, 2 М мочевину, и уравновешивают в буфере, содержащем 50 мМ Трис/HCl, 100 мМ NaCl, 100 мМ ДТТ, тем самым индуцируют автокаталитическое расщепление гибридного белка, и инкубируют 24 ч при 25°C. Дальнейшую очистку рекомбинантного тимозина β4 человека проводят посредством обращенно-фазовой жидкостной хроматографии. Анализ полученного продукта проводят при помощи ОФ ВЭЖХ. Фракции с содержанием белка ТВ4 не менее 98% объединяют и лиофилизуют. Выход рекомбинантного тимозина β4 составляет 3 мг из 100 г клеток или 3% суммарного белка клеток.

Идентификацию образующегося рекомбинантного человеческого тимозина β4 проводят с помощью TOF-ESI-масс-спектрометрии на масс-спектрометре Agilent technologies 6224. Полученный сигнал рекомбинантного тимозина β4 соответствует расчетному значению массы 4962 Да.


РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pER-TB4GyrA-AcSer, КОДИРУЮЩАЯ СЕРИНОВУЮ АЦЕТИЛТРАНСФЕРАЗУ, СПОСОБНУЮ in vivo АЦЕТИЛИРОВАТЬ N-КОНЦЕВОЙ СЕРИН ДЕЗАЦЕТИЛТИМОЗИНА β4 И ГИБРИДНЫЙ БЕЛОК, СПОСОБНЫЙ К АВТОКАТАЛИТИЧЕСКОМУ РАСЩЕПЛЕНИЮ С ОБРАЗОВАНИЕМ ТИМОЗИНА β4 ЧЕЛОВЕКА, ШТАММ Eschrichia coli C3030/pER-TB4GyrA-AcSer - ПРОДУЦЕНТ УКАЗАННЫХ БЕЛКОВ И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ГЕННО-ИНЖЕНЕРНОГО ТИМОЗИНА β4 ЧЕЛОВЕКА
РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pER-TB4GyrA-AcSer, КОДИРУЮЩАЯ СЕРИНОВУЮ АЦЕТИЛТРАНСФЕРАЗУ, СПОСОБНУЮ in vivo АЦЕТИЛИРОВАТЬ N-КОНЦЕВОЙ СЕРИН ДЕЗАЦЕТИЛТИМОЗИНА β4 И ГИБРИДНЫЙ БЕЛОК, СПОСОБНЫЙ К АВТОКАТАЛИТИЧЕСКОМУ РАСЩЕПЛЕНИЮ С ОБРАЗОВАНИЕМ ТИМОЗИНА β4 ЧЕЛОВЕКА, ШТАММ Eschrichia coli C3030/pER-TB4GyrA-AcSer - ПРОДУЦЕНТ УКАЗАННЫХ БЕЛКОВ И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ГЕННО-ИНЖЕНЕРНОГО ТИМОЗИНА β4 ЧЕЛОВЕКА
РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pER-TB4GyrA-AcSer, КОДИРУЮЩАЯ СЕРИНОВУЮ АЦЕТИЛТРАНСФЕРАЗУ, СПОСОБНУЮ in vivo АЦЕТИЛИРОВАТЬ N-КОНЦЕВОЙ СЕРИН ДЕЗАЦЕТИЛТИМОЗИНА β4 И ГИБРИДНЫЙ БЕЛОК, СПОСОБНЫЙ К АВТОКАТАЛИТИЧЕСКОМУ РАСЩЕПЛЕНИЮ С ОБРАЗОВАНИЕМ ТИМОЗИНА β4 ЧЕЛОВЕКА, ШТАММ Eschrichia coli C3030/pER-TB4GyrA-AcSer - ПРОДУЦЕНТ УКАЗАННЫХ БЕЛКОВ И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ГЕННО-ИНЖЕНЕРНОГО ТИМОЗИНА β4 ЧЕЛОВЕКА
Источник поступления информации: Роспатент

Showing 91-100 of 122 items.
24.05.2019
№219.017.5ee4

Рекомбинантная плазмидная днк pfuse-marx-29-prad-f2a/bche-14, содержащая ген модифицированной бутирилхолинэстеразы человека, предназначенная для экспрессии гена бутирилхолинэстеразы в клетках млекопитающих для терапии отравлений фосфорорганическими токсинами

Изобретение относится к биотехнологии, а именно: к технологии получения рекомбинантной бутирилхолинэстеразы человека (БуХЭ), и может быть использовано в медицине в терапии отравлений фосфорорганическими токсинами, для терапии отравлений наркотическими веществами типа кокаин, для терапии...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002688729
Дата охранного документа: 22.05.2019
06.07.2019
№219.017.a73f

Генетическая конструкция pa21/fab, для получения одноцепочечного антитела, слитого с константным фрагментом иммуноглобулина человека, стереоселективно взаимодействующего с фосфорорганическими соединениями.

Изобретение относится к биотехнологии, в частности к генетической конструкции pA21/Fab. Изобретение решает задачу получения рекомбинантного одноцепочечного антитела человека, стереоселктивно взаимодействующего с фосфорорганическими соединениями. 3 ил., 3 пр.
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002693553
Дата охранного документа: 04.07.2019
17.07.2019
№219.017.b5d6

Клеточная линия hufshkkc6 - продуцент рекомбинантного человеческого фолликулостимулирующего гормона (фсг) и способ получения фсг с использованием данной линии

Изобретение относится к клеточным технологиям и может быть использовано для рекомбинантного получения фолликулостимулирующего гормона (ФСГ) человека. Клеточную линию huFSHKKc6 получают путем трансформации клеток huFSHIK экспрессионной плазмидой длиной 7719 п.о., состоящей из гена устойчивости...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002694598
Дата охранного документа: 16.07.2019
19.07.2019
№219.017.b5f8

Клеточная линия крысиной глиомы c6-dda, устойчивая к цитотоксическому действию n-ацилдофаминов, для изучения механизмов действия биоактивных липидов

Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к клеточной линии крысиной глиомы С6-DDA. Клеточная линия крысиной глиомы C6-DDA является устойчивой к цитотоксическому действию N-ацилдофаминов как тест-культура для изучения механизмов действия биоактивных липидов, получена на основе...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002694868
Дата охранного документа: 17.07.2019
21.08.2019
№219.017.c1d4

Вспомогательный плазмидный лентивирусный экспрессионный вектор для получения высоких титров vpx-содержащих лентивирусных частиц, обеспечивающий эффективное заражение моноцитов и дендритных клеток человека

Изобретение относится к области биотехнологии и может быть использовано в терапии онкологических заболеваний. Описан универсальный вспомогательный плазмидный экспрессионный лентивирусный вектор для получения высоких титров вирусных частиц, содержащих ген Vpx, включающий в качестве базовых...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002697781
Дата охранного документа: 19.08.2019
22.08.2019
№219.017.c214

Генетическая конструкция для индукции пролиферации периферических моноцитов in vitro

Изобретение относится к области биотехнологии. Предложена генетическая конструкция для индукции пролиферации периферических моноцитов и дендритных клеток in vitro, полученных из крови человека, включающая последовательности, кодирующие транскрипционные факторы с-Мус и BMI1, а также их...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002697797
Дата охранного документа: 19.08.2019
24.08.2019
№219.017.c380

Способ калибровки объема раствора для микроинъекции в предовуляторные ооциты мыши

Изобретение относится к области биотехнологии. Предложен способ калибровки объема раствора от 1 до 10 пл для микроинъекции в предовуляторные ооциты мыши. Способ осуществляют с использованием инъецирующего капилляра с параллельными стенками и известными внешним, внутренним диаметрами, где...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002698140
Дата охранного документа: 22.08.2019
01.09.2019
№219.017.c4f6

Способ получения лигнана, обладающего анальгетическим действием

Изобретение относится к области органической химии, преимущественно связанной с синтезом биологически активных природных соединений - лигнанов и их синтетических аналогов. Конкретным конечным продуктом является молекула севанол, которая представляет собой перспективное терапевтическое средство...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002698725
Дата охранного документа: 29.08.2019
02.10.2019
№219.017.ce5d

Рекомбинантная плазмидная днк ptrx-tevrs-ртн, кодирующая гибридный белок, способный к протеолитическому расщеплению с образованием фрагмента эндогенного человеческого паратиреоидного гормона (1-34), штамм escherichia coli bl21(de3)/ptrx-tevrs-ртн - продуцент указанного белка и способ получения рекомбинантного pth (1-34)

Изобретение относится к области биотехнологии, конкретно к рекомбинантному получению терапевтических белков и может быть использовано для получения активного фрагмента (1-34) эндогенного человеческого паратиреоидного гормона. Сконструирована рекомбинантная плазмидная ДНК pTrx-TEVrs-РТН, которая...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002700452
Дата охранного документа: 17.09.2019
04.10.2019
№219.017.d246

Рекомбинантный белок, обладающий протективным действием в отношении менингококков (варианты), полинуклеотид, кодирующий рекомбинантный белок, рекомбинантная плазмидная днк, содержащая указанный полинуклеотид, клетка-хозяин, содержащая указанную рекомбинантную плазмидную днк, способ получения рекомбинантного белка

Группа изобретений относится к биотехнологии. Предложен рекомбинантный белок, обладающий протективным действием в отношении менингококков, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, состоящий из трех фрагментов первичной структуры IgA протеазы Neisseria meningitidis серогруппы В,...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002701964
Дата охранного документа: 02.10.2019
Showing 71-80 of 80 items.
19.08.2018
№218.016.7d8a

Рекомбинантная плазмидная днк perig-pgs, кодирующая гибридный белок, способный к автокаталитическому расщеплению с образованием антиангиогенного пептида пигастина - производного фрагмента [44-77] фактора роста пигментного эпителия человека, штамм escherichia coli bl21(de3)/perig-pgs - продуцент указанного белка, и способ получения рекомбинантного антиангиогенного пептида

Изобретение относится к области генной инженерии, конкретно к рекомбинантному получению антиангиогенных белков, и может быть использовано в медицине. Сконструирована рекомбинантная плазмидная ДНК pERIG-PGS, обеспечивающая синтез в клетках Escherichia coli гибридного белка GyrA-PGS, содержащего...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002664199
Дата охранного документа: 15.08.2018
11.03.2019
№219.016.dd17

Сенсибилизатор и способ фотообеззараживания воды

Изобретение относится к химии и химической технологии, в частности, к фталоцианиновым сенсибилизаторам и их применению для очистки воды от бактериального загрязнения. Предложены новые фталоцианины, представляющие собой кватернизованные производные тетра(3-тиофенил)фталоцианинов алюминия и цинка...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002448135
Дата охранного документа: 20.04.2012
19.04.2019
№219.017.2bfe

Штамм бактерий escherichia coli bl21/ppins07(bl07)-продуцент проинсулина человека

Изобретение относится к генной инженерии и касается нового штамма бактерий Escherichia coli, который может быть использован для получения высокоочищенного генно-инженерного инсулина человека. Путем трансформации клеток E.coli BL21 плазмидной ДНК pINS07, определяющей синтез проинсулина, получают...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002267534
Дата охранного документа: 10.01.2006
18.05.2019
№219.017.572d

Способ увеличения срока эксплуатации сорбента при промышленной очистке генно-инженерного инсулина человека

Способ относится к области биотехнологии, а именно к способу увеличения срока эксплуатации сорбента при промышленной очистке генно-инженерного инсулина человека. Способ включает высокоэффективную жидкостную хроматографию с использованием подвижной фазы, содержащей смесь органического...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002383624
Дата охранного документа: 10.03.2010
09.06.2019
№219.017.7c03

Способ получения 9-(β-d-арабинофуранозил)-2-фтораденина

Изобретение относится к способу получения 9-(β-D-арабинофуранозил)-2-фтораденина (флударабина), включающему взаимодействие 2-фтораденозина и 1-β-D-арабинофуранозилурацила при их мольном соотношении - 1:2 соответственно, в калий-фосфатном буфере при нейтральном значении рН, температуре 48-52°С в...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002368662
Дата охранного документа: 27.09.2009
09.06.2019
№219.017.7c5d

Способ получения генно-инженерного инсулина человека

Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к получению генно-инженерного инсулина человека для изготовления лекарственных препаратов, применяемых при лечении сахарного диабета. Способ осуществляют путем культивирования штамма-продуцента гибридного белка, содержащего проинсулин...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002322504
Дата охранного документа: 20.04.2008
17.07.2019
№219.017.b5d6

Клеточная линия hufshkkc6 - продуцент рекомбинантного человеческого фолликулостимулирующего гормона (фсг) и способ получения фсг с использованием данной линии

Изобретение относится к клеточным технологиям и может быть использовано для рекомбинантного получения фолликулостимулирующего гормона (ФСГ) человека. Клеточную линию huFSHKKc6 получают путем трансформации клеток huFSHIK экспрессионной плазмидой длиной 7719 п.о., состоящей из гена устойчивости...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002694598
Дата охранного документа: 16.07.2019
02.10.2019
№219.017.ce5d

Рекомбинантная плазмидная днк ptrx-tevrs-ртн, кодирующая гибридный белок, способный к протеолитическому расщеплению с образованием фрагмента эндогенного человеческого паратиреоидного гормона (1-34), штамм escherichia coli bl21(de3)/ptrx-tevrs-ртн - продуцент указанного белка и способ получения рекомбинантного pth (1-34)

Изобретение относится к области биотехнологии, конкретно к рекомбинантному получению терапевтических белков и может быть использовано для получения активного фрагмента (1-34) эндогенного человеческого паратиреоидного гормона. Сконструирована рекомбинантная плазмидная ДНК pTrx-TEVrs-РТН, которая...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002700452
Дата охранного документа: 17.09.2019
15.02.2020
№220.018.0277

Способ получения пептида, модулирующего активность пуринергических рецепторов

Изобретение относится к области биотехнологии, конкретно к рекомбинантному получению биологически активных полипептидов, которые обладают модулирующим действием на участвующие в генерации болевого сигнала клеточные рецепторы, и может быть использовано для получения пептида РТ6 в системе...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002714114
Дата охранного документа: 11.02.2020
19.03.2020
№220.018.0d57

Рекомбинантная плазмидная днк, кодирующая гибридный белок l-hep, штамм escherichia coli продуцент указанного белка и способ получения рекомбинантного белка

Изобретение относится к области биотехнологии, в частности к генной инженерии и в частности к рекомбинантному белку L-HEP-HG6-CBD, рекомбинантному белку, который используется для получения рекомбинантного белка L-HEP-HG6-CBD, рекомбинантной плазмидной ДНК pET32b-L-HEP-HG6-CBD для экспрессии...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002716975
Дата охранного документа: 17.03.2020
+ добавить свой РИД