×
20.10.2014
216.013.0071

ГЕН ЗВЕЗДЧАТКИ Stellaria media, КОДИРУЮЩИЙ АНТИМИКРОБНЫЙ ПЕПТИД Sm-AMP-X

Вид РИД

Изобретение

Юридическая информация Свернуть Развернуть
Краткое описание РИД Свернуть Развернуть
Аннотация: Изобретение относится к области биохимии, в частности к гену звездчатки Stellaria media, кодирующему антимикробный пептид звездчатки Stellaria media Sm-AMP-Х, обладающему последовательностью SEQ ID №1. Изобретение решает задачу пополнения ассортимента защитных генов растений для использования в биотехнологии при создании новых форм растений, устойчивых к факторам внешней среды, с помощью методов генной инженерии. 2 табл., 1 пр.
Основные результаты: Ген звездчатки Stellaria media, кодирующий антимикробный пептид звездчатки Stellaria media Sm-AMP-X, обладающий последовательностью SEQ ID №1.
Реферат Свернуть Развернуть

Изобретение относится к области биотехнологии растений, конкретно к защитным генам растений, кодирующим антимикробные пептиды (АМР), и может быть использовано для создания сельскохозяйственных культур, устойчивых к патогенам.

В настоящее время более 1 миллиарда человек на Земле недоедают [FAO, 2009. The state of food security in the world 2009. Electronic Publishing Policy and Support Branch Communication Division FAO. http://www.fao.org/docrep/012/i0876e/i0876e00.htm (accessed 23 April 2010)]. При этом население Земли продолжает расти. По прогнозам, к 2050 году оно увеличится на 2-2.5 миллиарда человек [UN Population Council, 2003. Demographic 2000-2050 according to the 2002 revision of the United Nations population projections. Popul. Dev. Rev. 29, 139-145]. Предполагаемое изменение климата и сокращение запасов воды усугубляет проблему обеспечения продовольствием растущее население Земного шара. Все это требует разработки новых сельскохозяйственных систем и технологий для повышения урожайности и качества сельскохозяйственной продукции. Борьба с патогенами и вредителями сельскохозяйственных культур является важнейшей составной частью современного земледелия. Однако в существующем виде практика ведения сельского хозяйства приводит к значительным потерям плодородного слоя почвы и ее чрезмерным загрязнением химическими средствами защиты растений (пестицидами и фунгицидами), что ухудшает экологическую обстановку и губительно для здоровья человека.

Внедрение достижений генетической инженерии, которая позволяет встраивать чужеродные гены, обусловливающие ценные сельскохозяйственные признаки, в геномы культурных растений способно решить многие из указанных проблем. В настоящее время созданы и успешно используются трансгенные растения, обладающие устойчивостью к герибицидам, что позволяет облегчить и усовершенствовать технологию обработки сельскохозяйственных земель и замедляет эрозию почвы, а также растения, устойчивые к насекомым-вредителям, что существенно сокращает объемы используемых для обработки пестицидов. Устойчивость к насекомым-вредителям обеспечивается генами энтомотоксинов бактерии Bacillus thuringiensis [Andrews R.E., Faust R.M., Wabiko H., Raymond K.C., Bulla L.A. The biotechnology of Bacillus thuringiensis. // Crit. Rev. Biotech. 1987. Vol. 6. P. 163-232; Vaeck M., Reynaerts A., Höfte H., Jansens S., De Beuckeleer M., Dean C., Zabeau M., Van Montagu M., Leemans J. Transgenic plants protected from insect attack. // Nature 1987. Vol. 328. P. 33-37]. Генетически модифицированные сельскохозяйственные культуры, устойчивые к гербицидам и насекомым-вредителям, успешно выращиваются в Соединенных Штатах Америки, Бразилии, Аргентине, Индии, Канаде, Китае, Парагвае и Южной Африке на площадях, достигающих 134 млн. га [James C. 2009. Global status of commercialized Biotech/GM crops. ISAAA Brief 41. Executive Summary. http://www.isaaa.org/resources/publications/briefs/41/executive summary/default.asp (accessed 23 April 2010]. Использование культур, устойчивых к гербицидам (преимущественно глифосату) и растительноядным насекомым, во многих случаях приводит к увеличению их урожайности [Munkvold G.P., Hellmich R.L., Rice L.G. Comparison of fumonisin concentrations in kernels of transgenic Bt maize hybrids and non-transgenic hybrids. Plant Dis. 1999. Vol. 81. P. 556-565].

В то время как используя методы генетической инженерии, уже удалось достичь значительных успехов в создании и внедрении в практику сортов, устойчивых к гербицидам и насекомым-вредителям, а на стадии испытаний находятся генетически модифицированные растения, которые обладают улучшенными пищевыми качествами или повышенной урожайностью, устойчивы к засухе или другим видам абиотического стресса, на рынке до сих пор не представлены культуры, устойчивые к грибным и бактериальным заболеваниям [Park J.R., McFarlane I., Phipps R.H., Ceddia G. The role of transgenic crops in sustainable development. Plant Biotechnology Journal 2011.Vol. 9. P. 2-21].

Наибольший интерес в направлении создания таких культур представляют гены антимикробных пептидов растений. Антимикробные пептиды являются важнейшими компонентами иммунной системы растений. Они обладают широким спектром антимикробного действия, не вызывают появления устойчивых форм, и их гены могут быть непосредственно встроены в геном чувствительных к патогенам растений. Дикорастущие сорные растения, которые обладают повышенной устойчивостью к патогенам, являются перспективными донорами генов новых высокоактивных антимикробных пептидов.

Stellaria media - мокрица, или звездчатка средняя, является широко распространенным сорным растением. Звездчатка средняя относится к семейству Гвоздичные Caryophyllaceae, классу двудольные Dicotyledones (Liliopsida), отделу покрытосеменные (цветковые) Magnoliophyta (Angiospermae). В ряде стран она используется в качестве листовой овощной культуры, поэтому применение генов этого растения для улучшения свойств сельскохозяйственных культур, в частности, генов антимикробных пептидов для повышения устойчивости к фитопатогенам, представляется безопасным для здоровья человека и сельскохозяйственных животных.

Изобретение решает задачу расширения ассортимента защитных генов растений для использования в биотехнологии при создании новых форм растений, устойчивых к факторам внешней среды, с помощью методов генетической инженерии.

Поставленная задача решается с помощью гена звездчатки Stellaria media, кодирующего антимикробный пептид звездчатки Stellaria media sm-amp-x, обладающего последовательностью SEQ ID №1. Антимикробный пептид звездчатки Stellaria media sm-amp-x проявляет антифунгальную активность в тестах in vitro против Aspergillus niger, Fusarium solani и Fusarium oxysporum в микромолярных концентрациях (Таблица 1). Это означает, что ген звездчатки sm-amp-x можно использовать для повышения устойчивости растений к патогенам c использованием методов генетической инженерии.

Гомологичных ДНК и кДНК к заявленной нуклеотидной последовательности ранее известно не было.

Таблица 1.

Антифунгальное действие пептида Sm-AMP-X, кодируемого нуклеотидной последовательностью sm-amp-x и выделенного из Stellaria media L., на конидии грибов через 24 часа после заражения.

Гриб IC50, мкМ*
Aspergillus niger 4,0
Fusarium solani 7,2
Fusarium oxysporum 5,4
*IC50 соответствует концентрации пептида, при которой достигается 50%-ное ингибирование прорастания спор гриба.

Нуклеотидная последовательность sm-amp-x (SEQ ID №1) соответствует кодирующей части кДНК (мРНК), полученной из проростков звездчатки Stellaria media.

Нуклеотидная последовательность sm-amp-x кодирует белок-предшественник защитного пептида Sm-AMP-X длиной 478 аминокислотных остатков (SEQ ID №2), состоящий из N-концевого сигнального пептида длиной 20 аминокислотных остатков, 11 предположительно пептидных доменов, зрелого пептидного домена из 33 остатков и C-концевого продомена длиной 19 остатков.

Техническим результатом изобретения является модульная структура гена, кодирующего защитный пептид Sm-AMP-X.

Изобретение иллюстрируют следующие примеры.

Пример 1.

Установление структуры кДНК звездчатки Stellaria media, кодирующей новый антимикробный пептид Sm-Amp-X.

Аминокислотная последовательность пептида Sm-Amp-X:

ValAspProAspValArgAlaTyrCysLysHisGlnCysMetSerThrArgGlyAspGlnAlaArgLysIle CysGluSerValCysMetArgGlnAsp.

Тотальную РНК выделяют из 5-дневных проростков с помощью набора реагентов Trizol RNA Prep 100 (Изоген, Россия) в соответствии с протоколом фирмы-производителя. 2 мкг тотальной РНК используют в качестве матрицы для синтеза кДНК с помощью набора Mint (Евроген, Россия).

Определение структуры кДНК проводят в несколько этапов: определение 3'-концевой части кДНК, определение 5'-концевой части кДНК, получение кодирующей части гена. Для двуступенчатой ПЦР с целью определения 3'-концевой части кДНК на основе известной аминокислотной последовательности пептида Sm-AMP-X были сконструированы и синтезированы праймеры 4CDir1 и 4C Dir2 (Таблица 2).

Таблица 2.

Последовательности праймеров.

Для 3'-области кДНК 4СDir1 5′- GTAGATCCAGA(T/C)GT(A/C/T/G)(A/C)G(A/C/T/G)GC-3′
4СDir2 5′-GCATA(T/C)TG(T/C)AA(A/G)CA(T/C)CA(A/G)TG(T/C)ATG-3′
Универсальный
праймер
T7Cap 5′-GTAATACGACTCACTATGGGCAAGCAGTGGTAACAACGCAGAGT-3′
Для 5'-области кДНК 4СRev1 5ґ-ATCAAACCAAAGAGCTAACTTATAC-3ґ

3'-концевую область кДНК амплифицируют с помощью двуступенчатой ПЦР, для первого раунда амплификации используют универсальный праймер T7Cap и специфический праймер 4C Dir1, для второго раунда - универсальный праймер T7Cap и специфический праймер 4C Dir2. Амплифицированные фрагменты клонируют и секвенируют на автоматическом секвенаторе.

На основе установленных нуклеотидных последовательностей фрагментов кДНК был сконструирован и синтезирован праймер для амплификации 5'-областей кДНК sm-amp-x: 4Crev1 (Таблица 2). 5'-фрагмент кДНК амплифицируют с использованием универсального праймера T7Cap и специфического праймера 4Crev1. В результате получают полноразмерную кДНК sm-amp-x, кодирующую белок-предшественник пептида Sm-AMP-X.

Ген звездчатки Stellaria media, кодирующий антимикробный пептид звездчатки Stellaria media Sm-AMP-X, обладающий последовательностью SEQ ID №1.
Источник поступления информации: Роспатент

Показаны записи 1-7 из 7.
27.05.2013
№216.012.447c

Гены пшеницы triticum kiharae, кодирующие антимикробные пептиды

Изобретение относится к области биохимии. Представлен ген пшеницы Triticum kiharae, обладающий нуклеотидной последовательностью SEQ ID №1, кодирующей антимикробные пептиды пшеницы Кихара Triticum kiharae Tk-AMP. Изобретение позволяет создавать устойчивые к патогенам растения с использованием...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002483109
Дата охранного документа: 27.05.2013
27.07.2014
№216.012.e50a

Способ получения форм картофеля in vitro, устойчивых к возбудителям фитофтороза и альтернариоза

(57) Изобретение относится к области биотехнологии и генной инженерии. Листовые экспланты, вычлененные из тридцатидневных асептических растений исходных сортов, выращенных в сосудах 1 л, помещают в чашки Петри с жидкой средой определенного состава и прединкубируют, кокультивируют и культивируют...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002524424
Дата охранного документа: 27.07.2014
10.04.2016
№216.015.2fc4

Способ детекции аминов

Изобретение относится к области аналитической химии и касается способа определения амина в образце. Сущность способа заключается в контактировании образца, содержащего амин, с раствором соли, содержащей 2,2',2”,6,6',6”-гексаметокситритильный карбокатион, и последующем определении конъюгатов...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002580653
Дата охранного документа: 10.04.2016
13.01.2017
№217.015.85ca

Пептид звездчатки stellaria media l., обладающий антифунгальной активностью

Изобретение относится к области биохимии, в частности к пептиду Sm-AMP3, обладающему антифунгальной активностью. Изобретение позволяет эффективно защищать растения от поражения патогенными грибами. 1 ил., 1 табл., 4 пр.
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002603058
Дата охранного документа: 20.11.2016
26.08.2017
№217.015.e7ef

Штамм bacillus pumilus и способ получения антибиотика амикумацина а с его применением

Группа изобретений относится к биотехнологии. Способ получения амикумацина предусматривает культивирование штамма бактерий Bacillus pumilus ВКПМ В-12548 на жидкой питательной среде, содержащей сахарозу, глюкозу, дрожжевой экстракт, КНРО, NaCl, MgSO, (NH)SO, FeSO×7HO, MnCl×4HO, CaCO и...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002627187
Дата охранного документа: 03.08.2017
13.02.2018
№218.016.24ed

Аттенуированный штамм вируса - биологический препарат для защиты растений огурца от патогенных штаммов вируса зеленой крапчатой мозаики огурца

Изобретение относится к области биохимии, в частности к аттенуированному штамму вируса зеленой крапчатой мозаики огурца. Изобретение позволяет эффективно защищать растения огурца от патогенных штаммов вируса зеленой крапчатой мозаики огурца. 2 табл., 3 пр.
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002642321
Дата охранного документа: 24.01.2018
04.04.2018
№218.016.313a

Способ получения антимикробных пептидов из тромбоцитов курицы домашней

Изобретение относится к области медицины, а именно к микробиологии и биохимии, и предназначено для получения антимикробных пептидов. Для получения антимикробных пептидов из тромбоцитов курицы домашней осуществляют следующие сбор свежей крови кур в пластиковые контейнеры с добавлением 3,8%...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002645070
Дата охранного документа: 15.02.2018
Показаны записи 1-10 из 13.
27.05.2013
№216.012.447c

Гены пшеницы triticum kiharae, кодирующие антимикробные пептиды

Изобретение относится к области биохимии. Представлен ген пшеницы Triticum kiharae, обладающий нуклеотидной последовательностью SEQ ID №1, кодирующей антимикробные пептиды пшеницы Кихара Triticum kiharae Tk-AMP. Изобретение позволяет создавать устойчивые к патогенам растения с использованием...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002483109
Дата охранного документа: 27.05.2013
27.07.2014
№216.012.e50a

Способ получения форм картофеля in vitro, устойчивых к возбудителям фитофтороза и альтернариоза

(57) Изобретение относится к области биотехнологии и генной инженерии. Листовые экспланты, вычлененные из тридцатидневных асептических растений исходных сортов, выращенных в сосудах 1 л, помещают в чашки Петри с жидкой средой определенного состава и прединкубируют, кокультивируют и культивируют...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002524424
Дата охранного документа: 27.07.2014
10.04.2016
№216.015.2fc4

Способ детекции аминов

Изобретение относится к области аналитической химии и касается способа определения амина в образце. Сущность способа заключается в контактировании образца, содержащего амин, с раствором соли, содержащей 2,2',2”,6,6',6”-гексаметокситритильный карбокатион, и последующем определении конъюгатов...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002580653
Дата охранного документа: 10.04.2016
13.01.2017
№217.015.85ca

Пептид звездчатки stellaria media l., обладающий антифунгальной активностью

Изобретение относится к области биохимии, в частности к пептиду Sm-AMP3, обладающему антифунгальной активностью. Изобретение позволяет эффективно защищать растения от поражения патогенными грибами. 1 ил., 1 табл., 4 пр.
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002603058
Дата охранного документа: 20.11.2016
26.08.2017
№217.015.e7ef

Штамм bacillus pumilus и способ получения антибиотика амикумацина а с его применением

Группа изобретений относится к биотехнологии. Способ получения амикумацина предусматривает культивирование штамма бактерий Bacillus pumilus ВКПМ В-12548 на жидкой питательной среде, содержащей сахарозу, глюкозу, дрожжевой экстракт, КНРО, NaCl, MgSO, (NH)SO, FeSO×7HO, MnCl×4HO, CaCO и...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002627187
Дата охранного документа: 03.08.2017
13.02.2018
№218.016.24ed

Аттенуированный штамм вируса - биологический препарат для защиты растений огурца от патогенных штаммов вируса зеленой крапчатой мозаики огурца

Изобретение относится к области биохимии, в частности к аттенуированному штамму вируса зеленой крапчатой мозаики огурца. Изобретение позволяет эффективно защищать растения огурца от патогенных штаммов вируса зеленой крапчатой мозаики огурца. 2 табл., 3 пр.
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002642321
Дата охранного документа: 24.01.2018
04.04.2018
№218.016.313a

Способ получения антимикробных пептидов из тромбоцитов курицы домашней

Изобретение относится к области медицины, а именно к микробиологии и биохимии, и предназначено для получения антимикробных пептидов. Для получения антимикробных пептидов из тромбоцитов курицы домашней осуществляют следующие сбор свежей крови кур в пластиковые контейнеры с добавлением 3,8%...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002645070
Дата охранного документа: 15.02.2018
14.03.2019
№219.016.deef

Штамм streptomyces hygroscopicus 18 - продуцент нафтохиноновых антибиотиков - астолидов а и в с противогрибковой и цитотоксической активностью и способ их получения

Предложена группа изобретений, относящихся к биотехнологии - штамм Streptomyces hygroscopicus ВКПМ Ас-2079 - продуцент антибиотиков астолидов А и В и способ получения антибиотиков астолида А и астолида В с применением указанного штамма. Штамм Streptomyces hygroscopicus 18, обладающий...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002681828
Дата охранного документа: 12.03.2019
15.03.2019
№219.016.e079

Способ оценки современной активности тектонических нарушений

Изобретение относится к сейсмотектонике и может быть использовано для оценки современной активности тектонических нарушений при инженерно-геологических изысканиях. Сущность: на исследуемой территории выявляют зоны неотектонических разломов. В выявленных зонах проводят полевое...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002393510
Дата охранного документа: 27.06.2010
09.05.2019
№219.017.4d5d

Способ определения времени, места и магнитуды землетрясения

Использование: для определения времени, места и магнитуды землетрясения. Сущность заключается в том, что осуществляют выявление сейсмогенерирующих зон, потенциально опасных для оснований сооружений различного назначения, размещают в этих зонах набор пунктов измерений геофизических величин,...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002370790
Дата охранного документа: 20.10.2009
+ добавить свой РИД