×
05.09.2019
219.017.c6e4

Результат интеллектуальной деятельности: Олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентно-меченные зонды, способ и тест-система для дифференциации генома вакцинного штамма и полевого изолята вируса заразного узелкового дерматита КРС с дополнительной детекцией генома каприпоксвирусов с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени

Вид РИД

Изобретение

Аннотация: Изобретение относится к биотехнологии, а именно к средствам молекулярной диагностики. Разработаны олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентно-меченные зонды для дифференциации генома вакцинного штамма и полевого изолята вируса заразного узелкового дерматита КРС с дополнительной детекцией генома каприпоксвирусов с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени: полевой изолят ЗУД КРС: f- 5'- TAGAAAATGGATGTACCACAAATACAG 3', r 5' -TTGTTACAACTCAAATCGTTAGGTG-3', зонд 5' -ACCACCTAATGATAGTGTTTATGATTTACC-3; каприпоксвирусы: f - 5' ATGAAACCAATGGATGGGATA 3', r - 5' CGAAATGAAAAACGGTATATGGA 3', зонд - 5' ATGAGCCATCCATTTTCCAA 3'4; вакцинный штамм ЗУД КРС: f- 5'-TGTTTCCATTCTCCACTGCT-3', r - 5' -TACTTACTAAAAAATGGGCGCА-3', зонд - 5'-TCGCTGACATCGTTAGTCCАСТС-3'. Предложен способ дифференциации генома вакцинного штамма и полевого изолята вируса заразного узелкового дерматита (нодулярного дерматита) КРС с дополнительной детекцией генома каприпоксвирусов с помощью ПЦР в режиме реального времени при одинаковом термическом профиле с использованием этих праймеров и зондов, и тест-система ПЦР в режиме реального времени для его проведения. Разработан высокочувствительный ПЦР-набор, состоящий из готовой ПЦР смеси, фермента Taq-полимеразы, положительного контроля и отрицательного контроля, позволяющий в кратчайшие сроки специфично выявить и дифференцировать геном. 3 н.п. ф-лы, 3 ил., 2 табл., 3 пр.

Изобретение относится к ветеринарной вирусологии, к средствам молекулярной диагностики, а именно к детекции и дифференциации генома вакцинного штамма и полевого изолята вируса заразного узелкового дерматита (нодулярного дерматита) КРС с дополнительной детекцией генома каприпоксвирусов в полимеразной цепной реакции в режиме реального времени.

Заболевания, вызываемые возбудителями, относящимися к роду Capripoxvirus (оспа овец, оспа коз, заразный узелковый дерматит (ЗУД) КРС), в соответствии с классификацией МЭБ относятся к категории особо опасных инфекционных болезней, подлежащих обязательной нотификации, способны вызывать эпизоотии и наносить огромный экономический ущерб животноводству, слагающийся из гибели и вынужденного убоя больных животных, снижения продуктивности, абортов и затрат на проведение ветеринарно-санитарных и охранно-карантинных мероприятий [3, 10].

Все каприпоксвирусы являются ДНК-содержащими оболочечными вирусами, которые относятся к семейству Poxviridae рода Capripoxvirus [5]. Геном вируса представлен двуцепочечной ДНК длиной 151 тыс. пар оснований [11].

Заразный узелковый дерматит (нодулярный дерматит) крупного рогатого скота (ЗУД КРС) - трансграничная инфекционная болезнь КРС, проявляющаяся повышением температуры тела, образованием кожных узлов (бугорков), при генерализации инфекционного процесса - лимфаденитом, поражением конъюнктивы, слизистых оболочек органов дыхания, пищеварения и воспроизводства [6, 8].

Заболеванию подвержены только крупный рогатый скот и буйволы [7]. Основным путем распространения болезни считается передача с кровососущими насекомыми, перечень которых многообразен и в настоящее время подлежит уточнению.

Более того, активное использование живых гомологичных вакцин против ЗУД на основе вакцинного штамма типа Neethling в приграничных странах, как со стороны Азии, так и ЕС, подчеркивает острую необходимость разработки комплекса методов для выявления и дифференциации возбудителей каприпоксвирусных инфекций, включая вакцинный штамм, который также способен вызывать клинические проявления болезни у животных [4, 9].

Известен способ дифференциации вакцинного штамма вируса ЗУД с помощью ПЦР с последующим анализом кривых плавления ампликонов с высоким разрешением (HRM) [1]. Недостатком этого способа является высокая зависимость чувствительности реакции от качества и концентрации ДНК в исследуемой пробе. Более того, различия температуры пиков в пределах 1°С затрудняет интерпретацию полученных результатов.

Наиболее близким к заявляемому методу является тест-система, которая основана на выявление геномов вакцинного и полевого штаммов вируса ЗУД в режиме дуплекс [2]. Недостатком данного метода является наличие конкуренции между праймерами при одновременном присутствии обоих вирусов, что особенно критично в начале кампании по вакцинированию живыми вакцинами.

Таким образом, технической проблемой является разработка метода способного выявлять и достоверно дифференцировать геномы полевых изолятов и вакцинных штаммов вирусов ЗУД в независимости от периода вакцинации.

Изобретение касается тест-системы, состоящей из олигонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченных зондов для дифференциации геномов вакцинного и полевого штаммов вируса заразного узелкового дерматита КРС с дополнительной детекцией генома каприпоксвирусов при проведении реакции в одинаковом термическом профиле. Представленный метод включает последовательности олигонуклеотидов, специфичные только для полевых изолятов вируса ЗУД КРС, вакцинного штамма и каприпоксвирусов, имеющие следующие нуклеотидные последовательности:

- Вакцинного штамма вируса ЗУД:

f- 5' -TGTTTCCATTCTCCACTGCT-3'

r - 5'-TACTTACTAAAAAATGGGCGCA-3',

зонд - 5'-TCGCTGACATCGTTAGTCCACTC-3';

- Каприпоксвирусов:

f- 5'-ATGAAACCAATGGATGGGATA-3'

r- 5'-CGAAATGAAAAACGGTATATGGA-3'

зонд - 5'-ATGAGCCATCCATTTTCCAA-3';

- Полевых изолятов вируса ЗУД:

f- 5'-AGAAAATGGATGTACCACAAATACAG-3'

r - 5'-TTGTTACAACTCAAATCGTTAGGTG-3'

зонд - 5'-ACCACCTAATGATAGTGTTTATGATTTACC-3'

В качестве источника флуоресценции на 5' конце зондов применяют краситель FAM, а для тушения флуоресценции на 3' конце - BHQ1. Флуоресценцию у всех зондов измеряют по каналу FAM.

При тестировании пробы на наличие геномов вакцинного штамма вируса ЗУД КРС, полевого изолята вируса ЗУД КРС и каприпоксвирусов:

- пересечение кривой флуоресценции линии threshold с праймерами на геном вакцинного штамма вируса ЗУД КРС и геном каприпоксвирусов свидетельствует о наличии в образце генома вакцинного штамма вируса;

- пересечение кривой флуоресценции линии threshold с праймерами на геном полевого изолята вируса ЗУД КРС и генома каприпоксвирусов свидетельствует о наличии в образце генома полевого изолята вируса;

- отсутствие пересечения кривой флуоресценции линии threshold для всех систем праймеров свидетельствует об отсутствии генома вируса ЗУД в исследуемом материале.

Изобретение может быть использовано в ветеринарии, клинической и лабораторной диагностике для дифференциации генома вакцинного и полевого штаммов вируса заразного узелкового дерматита КРС с дополнительной детекцией генома каприпоксвирусов в пробах патологического и биологического материала.

Технический результат от предлагаемого изобретения заключается в разработке современной, высокоспецифической тест-системы, предназначенной для дифференциации генома вакцинного штамма и полевого изолята вируса заразного узелкового дерматита (нодулярного дерматита) КРС с дополнительной детекцией генома каприпоксвирусов в полимеразной цепной реакции в режиме реального времени.

Сущность изобретения заключается в том, что специфичное выявление и дифференциация генома полевого изолята вируса ЗУД КРС от вакцинного штамма проводится с дополнительной детекцией генома каприпоксвирусов в индивидуальных пробирках при одном термическом профиле, что исключает возможную конкуренцию между праймерами во время амплификации.

1. При помощи пары праймеров для выявления генома полевого изолята вируса ЗУД КРС осуществляют ПЦР в режиме реального времени, позволяющей выявлять геном вирулентного штамма вируса ЗУД КРС. В качестве мишени выбран фрагмент гена наружного капсидного белка EEV с делецией 27 п.н., присутствующей у всех представителей вирусов сем. Capripoxviridae, включая вакцинные штаммы вируса ЗУД КРС, за исключением полевых изолятов вирусов ЗУД КРС.

2. При помощи праймеров для выявления генома вакцинного штамма вируса ЗУД проводят ПЦР в режиме реального времени, позволяющей выявлять геном аттенуированного вакцинного штамма вируса ЗУД КРС. В качестве мишени выбран фрагмент гена с неизвестной функцией, специфичный исключительно для вакцинных штаммов вирусов, полногеномные последовательности которых депонированы в базе данных GenBank.

3. При помощи праймеров и зонда для выявления генома каприпоксвирусов проводят ПЦР-РВ для выявления генома каприпоксвирусов. В качестве мишени выбран фрагмент гена, кодирующий поверхностный белок Р32, который консервативен для всех каприпоксвирусов, включая полевые и вакцинные штаммы вируса ЗУД КРС.

Сущность изобретения пояснена на графических материалах:

Фиг. 1: Линейность результатов ПЦР-РВ при тестировании 10-кратных разведений выделенной ДНК вируса ЗУД КРС штамма ВНД КРС/Дагестан/2015 (диагностический).

Фиг. 2: Линейность результатов ПЦР-РВ при тестировании 10-кратных разведений выделенной ДНК вируса оспы овец штамма «Афганский».

Фиг. 3: Линейность результатов ПЦР-РВ при тестировании 10-кратных разведений выделенной ДНК вакцинного штамма вируса ЗУД КРС типа Neethling.

С помощью программного обеспечения BLAST и лабораторных исследований показана высокая специфичность праймеров тест-систем метода.

В таблицах 1 и 2, представлены эффективность, стандартное отклонение (SD) и коэффициент детерминированности (r2), воспроизводимости и повторяемости тест-систем. Как представлено в таблице 1 эффективность тест-систем метода находится в диапазоне 90-99%, SD - 0,03-0,6; r2 - 0,99-1. Оценка воспроизводимости и повторяемости тест-систем показала, что все тест-системы являются высоковоспроизводимы, а коэффициент вариации не превышал 2%, как в пределах внутри запуска ПЦР, так и между запусками ПЦР (Табл. 2).

Детекция продуктов амплификации осуществляется методом регистрации флуоресценции, генерируемой в результате разрушения гибридизационного зонда, находящегося на 5'-конце красителя FAM, а на 3'-конце - гасителя BHQ1. При отсутствии выявляемой ДНК краситель и гаситель сближены, и наблюдается лишь незначительная флуоресценция, так как гаситель поглощает испускаемое красителем излучение. При накоплении в ходе ПЦР специфических продуктов зонд гибридизуется на ампликон, что ведет к его разрушению за счет 5'-экзонуклеазной активности Taq-полимеразы. В результате краситель отделяется от гасителя и его излучение может быть детектировано. Таким образом, увеличение флуоресценции прямо пропорционально количеству синтезированного ПЦР-продукта.

Праймеры и зонды разработаны для амплификации и детекции фрагмента гена EEV полевого изолята вируса ЗУД КРС, в котором у других представителей сем. Capripoxviridae, включая вакцинные штаммы вируса ЗУД КРС типа Neethling, присутствует делеция 27 п.н. в данном локусе, тогда как у полевых вирусов ЗУД КРС она отсутствует.

Праймеры и зонды разработаны для амплификации и детекции фрагмента гена с неизвестной функцией вакцинного штамма вируса ЗУД КРС, в котором присутствует специфический участок, который не обнаруживается у полевых изолятов вируса ЗУД и других каприпоксвирусов.

Праймеры и зонды на каприпоксвирусы комплиментарны консервативной области гена, кодирующего поверхностный белок Р32, и не комплиментарны каким-либо участкам генома других поксвирусам.

Для разработки праймеров из базы данных GenBank были получены полногеномные последовательности каприпоксвирусов. Последовательности выравнивали с помощью программы Bioedit, затем визуально оценивали консервативные участки, на основе которых был получен ряд праймеров. В результате тестирования при различных параметрах была получена оптимальная комбинация праймеров и зонда, которые показывают высокую чувствительность и специфичность при одном термическом профиле.

Набор для дифференциации генома вакцинного штамма и полевого изолята вируса заразного узелкового дерматита КРС с дополнительной детекцией генома каприпоксвирусов в ПЦР-РВ состоит из следующих компонентов:

№1. Готовая ПЦР смесь для выявления генома полевого изолята вируса ЗУД КРС, объем 550 мкл;

№2. Готовая ПЦР смесь на вакцинный штамм, объем 550 мкл;

№3. Готовая ПЦР смесь на каприпоксвирусы, объем 550 мкл;

№4. Фермент Taq-ДНК-полимераза, объем 37,5 мл;

№5. Положительный контрольный образец, объем 100 мкл;

№6. Отрицательный контрольный образец, объем 100 мкл.

ПЦР-РВ проводится в одну стадию с использованием готовых ПЦР смесей (№1, №2, №3), включающей на одну реакцию буфер 5х для ПЦР-РВ (5,0 мкл), 25 мМ хлорид магния (3,5 мкл), дезоксирибонуклеотид трифосфаты (0,5 мкл 10 пмолль), олигонуклеотидные праймеры (1 мкл каждого праймера 10 пмоль), зонд (1 мкл 5 пмоль) и фермента Taq-ДНК-полимеразу в программируемом амплификаторе. Перед началом постановки реакции необходимо разморозить все необходимые компоненты реакции, встряхнуть на шейкере, затем центрифугировать несколько секунд на низкоскоростной центрифуге.

Реакционную смесь для проведения ПЦР-РВ готовят в пробирке в расчете на одну реакцию (V=25 мкл) следующим образом:

- готовая ПЦР смесь(№1, №2, №3) 20,0 мкл,
- фермент Taq-ДНК-полимераза №2 0,25 мкл,
- выделенная ДНК (включая полож. контроль №5 и отриц. контроль №6) 5,0 мкл.

Приготовленную в отдельных 1,5 мл пробирках реакционные ПЦР-смеси на каждый из вирусов переносят в 0,2 мл пробирки по 20 мкл в каждую и вносят 5 мкл суммарной ДНК. В соответствующие пробы на каждый вирус вносят выделенные образцы ДНК, отрицательного и положительного контролей. Общий объем смеси - 25 мкл.

Устанавливают пробирки в амплификатор для постановки ПЦР-РВ, отмечают в программе расположение и характеристику проб, выбирают рабочий краситель (FAM), устанавливают в программе температурно-временной профиль реакции.

После первоначальной денатурации при 95°С в течение 10 мин ПЦР в режиме реального времени проводят в следующих условиях: 95°С - 15 с, 60°С - 60 с - 45 циклов.

Результаты интерпретируют на основании наличия или отсутствия пересечения кривой флуоресценции с пороговой линией, что соответствует о наличии или отсутствии значения порогового цикла «Ct» в соответствующей графе в таблице результатов реакции, выведенной в результате машинного анализа.

Результат считается достоверным только в случае прохождения положительного (Ct<35) и отрицательного (Ct не определен) контролей амплификации.

Образец считается положительным, если значение Ct не более 35. Однако в случае, если значение Ct для проб находится в пределах от 30 до 37, необходимо повторить реакцию с целью подтвердить или опровергнуть наличие ДНК искомого вируса в исследуемой пробе.

Образец считается отрицательным на наличие ДНК вируса, если для него значение Ct отсутствует или более 37.

Результаты не подлежат учету (считаются недействительными):

- в случае отсутствия регистрации роста флуоресценции в пробе с положительным контролем, что может свидетельствовать об ошибках, допущенных на этапе постановки ПЦР-РВ;

- в случае регистрации значения Ct в таблице результатов для отрицательного контрольного образца, что указывает на наличие контаминации.

В любом из этих случаев необходимо повторить анализ всех проб, а при повторном выявлении контаминации отрицательного контроля принять меры по выявлению и ликвидации источника контаминации.

Сущность предлагаемого изобретения пояснена примерами его использования, которые не ограничивают объем изобретения.

Пример 1. Оценка специфичности тест-системы

Для оценки специфичности тест-системы использовались следующие образцы гетерологичных вирусов, депонированных в коллекции штаммов микроорганизмов ФГБУ «ВНИИЗЖ»: ДНК вируса заразного узелкового дерматита штамма ВИД КРС/Дагестан/2015 (диагностический) [13], ДНК вируса заразного узелкового дерматита штамма ВНД КРС Э-95, ДНК вакцинного штамма (Onderstepoort, ЮАР), ДНК вируса оспы овец штамма «Афганский», ДНК вируса оспы овец вакцинного штамма «ВНИИЗЖ», ДНК вируса оспы коз штамма «Приморский 2003», ДНК вируса оспы коз штамма «ВНИИЗЖ 2003», ДНК вируса чумы мелких жвачных штамма «ВНИИЗЖ», ДНК вируса везикулярного стоматита штамма «ВНИИЗЖ», ДНК вируса оспы коров штамма «ВНИИЗЖ».

Работу с ДНК проводили в условиях, регламентированных Методическими указаниями МУ 1.3. 2569-09 «Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I-IV групп патогенности» [12].

Процедуру выделения ДНК из исследуемого материала проводили с использованием набора реагентов на основе мембранных колонок.

ПЦР в режиме реального времени проводили в реакционной смеси следующего состава (на 1 исследование):

- готовая ПЦР смесь №1 20,0 мкл,
- готовая ПЦР смесь №2 20,0 мкл,
- готовая ПЦР смесь №3 20,0 мкл,
- фермент Taq-ДНК-полимераза №4 0,25 мкл,
- выделенная ДНК (отриц. контроль №5) - 5,0 мкл.

ПЦР в режиме реального времени и регистрацию результатов проводили в ПЦР-РВ приборе по программе, описанной выше.

Результаты интерпретировали на основании наличия (или отсутствия) пересечения кривой флуоресценции с установленной на соответствующем уровне пороговой линии, что соответствует наличию (или отсутствию) значения порогового цикла Ct в соответствующей графе в таблице результатов. Результат считали положительным в случаи, если кривая накопления флуоресценции для соответствующего образца имела характерную «сигмовидную» форму и пересекала пороговую линию.

При тестировании специфичности тест-системы с использованием ДНК гомологичных и гетерологичных вирусов ложноположительных и ложноотрицательньгх результатов не выявлено.

Пример 2. Оценка чувствительности метода

Для оценки чувствительности тест-системы для выявления генома полевого штамма использовали ДНК вируса ЗУД КРС штамма ВНД КРС/Дагестан/2015 [13] с титром 5,21 lg ТЦЦ50/см3. Метод ПЦР-РВ выявлял ДНК вируса ЗУД КРС с чувствительностью 0,21 lg ТЦД50/см3. Для оценки эффективности амплификации было проведено 3 повторных эксперимента и получены значения Ct, которые использовались для вычисления эффективности. Полученные данные приведены на графическом изображении (Фиг. 1) С помощью средних значений Ct была получена линейная регрессия со значением эффективности амплификации (Е) 98,6% (Фиг. 1).

Для оценки чувствительности тест-системы для выявления генома каприпоксвирусов использовали ДНК вируса оспы овец штамм «Афганский» с титром 6,17 lg ТЦД50/СМ3. Метод ПЦР-РВ выявлял ДНК с чувствительностью 0,17 lg ТЦЦ50/см3. Для оценки эффективности амплификации было проведено 3 повторных эксперимента и получены значения Ct, которые использовались для вычисления эффективности. Полученные данные приведены на графическом изображении (Фиг. 2). С помощью средних значений Ct была получена линейная регрессия со значением эффективности амплификации (Е) 90,2% (Фиг. 2).

Для оценки чувствительности тест-системы для выявления генома вакцинного штамма вируса использовали ДНК вакцинного штамма вируса ЗУД КРС типа Neethling (Onderstepoort, ЮАР) с титром 5,21 lg ТЦД50/см3. Метод ПЦР-РВ выявлял ДНК с чувствительностью 0,21 lg ТЦЦ50/см3. Для оценки эффективности амплификации было проведено 3 повторных эксперимента и получены значения Ct, которые использовались для вычисления эффективности. Полученные данные приведены на графическом изображении (Фиг. 3) С помощью средних значений Ct была получена линейная регрессия со значением эффективности амплификации (Е) 95,16% (Фиг. 3).

Пример 3. Оценка воспроизводимости и повторяемости тест-систем метода.

Воспроизводимость для тест-системы на полевой изолят вируса ЗУД определяли с помощью величины стандартного отклонения (SD) для каждой серии разведений, используя полученные значения Ct. Стандартное отклонение SD варьировало от 0,11 до 0,33 на протяжении 5 10-кратных разведений. При этом коэффициент детерминации r2 составил 0,990 (Табл. 1).

Как, представлено в таблице 1, воспроизводимость для тест-системы на каприпоксвирусы определяли с помощью величины стандартного отклонения (SD) для каждой серии разведений, используя полученные значения Ct. Стандартное отклонение SD варьировало от 0,12 до 0,32 на протяжении 6-ти 10-кратных разведений. При этом коэффициент детерминации г2 составил 0,999.

Воспроизводимость для тест-системы на вакцинный штамм вируса ЗУД определяли с помощью величины стандартного отклонения (SD) для каждой серии разведений, используя полученные значения Ct. Стандартное отклонение SD варьировало от 0,03 до 0,6 на протяжении 5-ти 10-кратных разведений. При этом коэффициент детерминации г2 составил 0,998.

Вариабельность значений Ct (повторяемость) в пределах одного запуска и между запусками тест-систем метода представлена в таблице 2. Оценка воспроизводимости и повторяемости тест-систем показала, что все тест-системы являются высоковоспроизводимыми, а коэффициент вариации не превышал 2%, как в пределах внутри запуска ПЦР, так и между запусками ПЦР (Табл. 2).

Таким образом, изобретение может быть использовано в ветеринарной практике для дифференциации генетического материала полевого изолята вируса ЗУД КРС от вакцинного штамма в контролем на выявление генома каприпоксвирусов в биологических и культуральных образцах для постановки и уточнения диагноза, для решения научно-исследовательских задач по мониторингу распространения вируса ЗУД КРС среди восприимчивых животных. Использование специфических праймеров и зондов позволяет выявить и дифференцировать генетический материал полевого изолята вируса ЗУД КРС от вакцинного штамма в исследуемых образцах методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме реального времени (РВ).

Источники информации, принятые во внимание при составлении описания изобретения к заявке на выдачу патента РФ на изобретение «Олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентно-меченный зонды, способ и тест-система для дифференциации генома вакцинного штамма и полевого изолята вируса заразного узелкового дерматита КРС с дополнительной детекцией генома каприпоксвирусов с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени»:

1. A high-resolution melting (HRM) assay for the differentiation between Israeli field and Neethling vaccine lumpy skin disease viruses. Menasherow S, Erster O, Rubinstein-Giuni M, Kovtunenko A, Eyngor E, Gelman B, Khinich E, Stram Y. J Virol Methods. 2016 Jun; 232:12-5. doi: 10.1016/j.jviromet.2016.02.008

2. Agianniotaki EI, Chaintoutis SC, Haegeman A, Tasioudi KE, De Leeuw I, Katsoulos PD, Sachpatzidis A, De Clercq K, Alexandropoulos T, Polizopoulou ZS, Chondrokouki ED, Dovas CI. J Virol Methods. Development and validation of a TaqMan probe-based real-time PCR method for the differentiation of wild type lumpy skin disease virus from vaccine virus strains. 2017 Nov; 249:48-57. doi: 10.1016/j.jviromet.2017.08.011.

3. Beard, P.M. Lumpy skin disease: a direct threat to Europe. // Vet Rec, 2016, v. 28, p. 557-558.

4. T, I, N, I. Detection of lumpy skin disease virus in skin lesions, blood, nasal swabs and milk following preventive vaccination. Transbound Emerg Dis. 2017 Oct 30. doi: 10.1111/tbed.12730

5. Buller R.M., Arif В.M., Black D.N., Dumbell K.R, Esposito J.J., Lefkowitz E.J., McFadden G., Moss В., Mercer A.A., Moyer R.W., Skinner M.A., and Tripathy D.N. Family Poxviridae. In: Fauquet, С.M., M.A. Mayo, J. Maniloff, U. Desselberger, and L.A. Ball, (eds), Virus Taxonomy: Classification and Nomenclature of Viruses. Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, 2005, pp. 117-133. Elsevier Academic Press, San Diego

6. Coetzer J.A. W. Lumpy skin disease. In: Coetzer J.A. W. and R.C. Tustin, eds, Infectious Diseases of Live-stock. Oxford University Press, Cape Town, 2004, pp. 1268-1276.

7. Elhaig M.M., Selim A., Mahmoud M. Lumpy skin disease in cattle: Frequency of occurrence in a dairy farm and a preliminary assessment of its possible impact on Egyptian buffaloes. Onderstepoort J Vet Res. 2017 Mar 28; 84(1):e1-e6. doi: 10.4102/ojvr.v84i1.1393

8. Hunter P., D. Wallace. Lumpy skin disease in southern Africa: a review of the disease and aspects of control. J.S. Afr. Vet. Assoc, 2001, 72, 68-71.

9. Katsoulos PD, Chaintoutis SC, Dovas CI, Polizopoulou ZS, Brellou GD, Agianniotaki EI, Tasioudi KE, Chondrokouki E, Papadopoulos O, Karatzias H, Boscos C. Investigation on the incidence of adverse reactions, viraemia and haematological changes following field immunization of cattle using a live attenuated vaccine against lumpy skin disease. Transbound Emerg Dis. 2017 Apr 8. doi: 10.1111/tbed.12646.

10. M, M. Epidemiological and Molecular Studies on Lumpy Skin Disease Outbreaks in Turkey during 2014-2015. // Transbound Emerg Dis. 2016 (in Press).

11. Tulman E.R., Afonso C.L., Lu Z., Zsak L., Kutish G.F., Rock D.L. Genome of lumpy skin disease virus. J Virol. 2001 Aug; 75(15):7122-30

12. МУ 1.3.2569-09 «Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I-IV групп патогенности».

13. Патент РФ №2606254, С12№ 7/00, А62К 39/126 G01N 33/569 «Штамм вируса нодулярного дерматита крупного рогатого скота Dermatitis nodularis bovum рода Capripoxvirus для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики нодулярного дерматита крупного рогатого скота», 10.01.2017


Олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентно-меченные зонды, способ и тест-система для дифференциации генома вакцинного штамма и полевого изолята вируса заразного узелкового дерматита КРС с дополнительной детекцией генома каприпоксвирусов с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени
Олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентно-меченные зонды, способ и тест-система для дифференциации генома вакцинного штамма и полевого изолята вируса заразного узелкового дерматита КРС с дополнительной детекцией генома каприпоксвирусов с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени
Олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентно-меченные зонды, способ и тест-система для дифференциации генома вакцинного штамма и полевого изолята вируса заразного узелкового дерматита КРС с дополнительной детекцией генома каприпоксвирусов с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени
Источник поступления информации: Роспатент

Showing 1-10 of 57 items.
27.04.2013
№216.012.3955

Вакцина ассоциированная против ньюкаслской болезни, реовирусного теносиновита и метапневмовирусной инфекции птиц инактивированная эмульсионная

Изобретение относится к ветеринарии и касается вакцины ассоциированной против ньюкаслской болезни (НБ), реовирусного теносиновита (РВТ) и метапневмовирусной инфекции (МПВИ) птиц инактивированной эмульсионной, содержащей активное вещество и целевую добавку. В качестве целевой добавки вакцина...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002480238
Дата охранного документа: 27.04.2013
27.07.2013
№216.012.59e2

Линия клеток почки теленка bos taurus rbt (rene bos taurus) для репродукции вирусов животных

Изобретение относится к области вирусологии и биотехнологии. Постоянная линия клеток почки теленка Bos taurus RBT депонирована в 2010 году в РККК(П) (СХЖ РАСХН) под №74. Линия RBT получена из первично трипсинизированных клеток почки 2-месячного теленка в процессе 65 последовательных пассажей в...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002488631
Дата охранного документа: 27.07.2013
20.09.2013
№216.012.6bd2

Аттенуированный штамм "кэм-7" вируса оспы кур fowlpox virus для изготовления препаратов специфической профилактики и диагностики оспы птиц

Изобретение относится к области ветеринарной вирусологии и биотехнологии. Новый штамм «КЭМ-7» вируса оспы кур получен путем многократных пассажей материнского вируса на развивающихся эмбрионах кур. Штамм депонирован в коллекцию ФГБУ «ВГНКИ» под регистрационным номером (ссылкой) - штамм «КЭМ-7»...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002493253
Дата охранного документа: 20.09.2013
20.01.2014
№216.012.972d

Вакцина ассоциированная против парагриппа-3, инфекционного ринотрахеита и вирусной диареи крупного рогатого скота эмульсионная инактивированная

Изобретение относится к ветеринарной вирусологии и биотехнологии. Вакцина содержит активное вещество и целевую добавку. В качестве активного вещества вакцина содержит смесь из авирулентного очищенного антигенного материала из штамма «ВГНКИ-4» вируса ПГ-3 КРС, сем. Paramyxoviridae, рода...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002504400
Дата охранного документа: 20.01.2014
10.05.2014
№216.012.bfb7

Способ определения микотоксинов в продуктах животного и растительного происхождения

Предложен экспрессный, безопасный и экономичный способ определения микотоксинов в продуктах животного и растительного происхождения. Определение проводят из 2 г пробы, очищенный экстракт по QuEChERS делят на три части по 2 мл и используют в качестве диспергатора 300 мкл хлороформа в...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002514828
Дата охранного документа: 10.05.2014
10.05.2014
№216.012.c09d

Вакцина ассоциированная против вирусной диареи, ротавирусной и коронавирусной инфекций крупного рогатого скота эмульсионная инактивированная

Изобретение относится к области ветеринарной вирусологии и биотехнологии и касается вакцины против вирусной диареи, ротавирусной и коронавирусной инфекций крупного рогатого скота. Охарактеризованная вакцина содержит активное вещество и целевую добавку. В качестве активного вещества вакцина...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002515058
Дата охранного документа: 10.05.2014
27.06.2014
№216.012.d9b7

Применение этония в качестве адъюванта для производства сорбированной противоящурной вакцины

Изобретение относится к биотехнологии, ветеринарной вирусологии и микробиологии. Предложено применение этония в качестве адъюванта для производства сорбированной противоящурной вакцины, где этоний используют в виде 10%-ного водного раствора, который вносят в состав противоящурных вакцин в...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002521513
Дата охранного документа: 27.06.2014
27.08.2014
№216.012.ed4f

Вакцина против ящура типа а инактивированная сорбированная

Изобретение относится к области ветеринарной вирусологии и биотехнологии и касается вакцины против ящура типа А. Вакцина содержит авирулентный и очищенный антигенный материал из штамма вируса Aphtae epizooticae, сем. Picornaviridae, рода Aphtovirus, серотипа A, депонированного в коллекции ФГУ...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002526570
Дата охранного документа: 27.08.2014
10.06.2015
№216.013.54c2

Штамм вируса ящура aphtae epizooticae типа а для контроля антигенной и иммуногенной активности и для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура типа а

Изобретение относится к области ветеринарной вирусологии и биотехнологии и касается штамма вируса ящура Aphtae epizooticae типа А сем. Picomaviridae, рода Aphtovirus. Охарактеризованный штамм выделен от больных свиней и получен путем последовательных пассажей на чувствительных гетеро- и...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002553219
Дата охранного документа: 10.06.2015
20.08.2015
№216.013.701a

Штамм вируса ящура aphtae epizooticae типа а для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики ящура типа а и их контроля

Изобретение относится к области ветеринарной вирусологии и биотехнологии. Предложен штамм вируса ящура Aphtae epizooticae типа А сем. Picornaviridae, рода Aphtovirus, депонированный в коллекции ФГБУ «ВНИИЗЖ» под регистрационным номером штамм вируса ящура А №2171/Кабардино-Балкарский/2013....
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002560268
Дата охранного документа: 20.08.2015
Showing 1-10 of 24 items.
27.06.2013
№216.012.4fef

Устройство для мундштучного формования

Изобретение относится к устройствам для изготовления изделий методом экструдирования. Техническим результатом изобретения является расширение технологических возможностей устройства и повышение качества получаемых заготовок или изделий. Технический результат достигается устройством для...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002486056
Дата охранного документа: 27.06.2013
20.01.2014
№216.012.972d

Вакцина ассоциированная против парагриппа-3, инфекционного ринотрахеита и вирусной диареи крупного рогатого скота эмульсионная инактивированная

Изобретение относится к ветеринарной вирусологии и биотехнологии. Вакцина содержит активное вещество и целевую добавку. В качестве активного вещества вакцина содержит смесь из авирулентного очищенного антигенного материала из штамма «ВГНКИ-4» вируса ПГ-3 КРС, сем. Paramyxoviridae, рода...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002504400
Дата охранного документа: 20.01.2014
10.05.2014
№216.012.c09d

Вакцина ассоциированная против вирусной диареи, ротавирусной и коронавирусной инфекций крупного рогатого скота эмульсионная инактивированная

Изобретение относится к области ветеринарной вирусологии и биотехнологии и касается вакцины против вирусной диареи, ротавирусной и коронавирусной инфекций крупного рогатого скота. Охарактеризованная вакцина содержит активное вещество и целевую добавку. В качестве активного вещества вакцина...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002515058
Дата охранного документа: 10.05.2014
27.05.2015
№216.013.4ed0

Дилатометр

Изобретение относится к измерительной технике и может быть использовано для измерения линейных перемещений образца под воздействием температуры из различных материалов и для определения содержания углерода в углеродистых сталях. Дилатометр содержит измерительный узел и нагревательную печь,...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002551694
Дата охранного документа: 27.05.2015
27.03.2016
№216.014.daf9

Электропроводящая композиция

Изобретение относится к электропроводящим полимерным композициям и может быть использовано в качестве электропроводного материала при изготовлении труб, прутков, пленок и т.д. Композиция содержит полиэтилен высокой плотности в виде порошка с размером частиц 0,5-1 мм, терморасширенный графит с...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002579115
Дата охранного документа: 27.03.2016
27.08.2016
№216.015.4d2f

Устройство для экструдирования композиции из полимера и графита

Изобретение относится к устройствам для изготовления изделий методом экструдирования. Устройство для экструдирования композиции из полимера и графита содержит полую обойму цилиндрической формы, в которую вставлена цилиндрической формы полая матрица с пуансоном цилиндрической формы в ней. Обойма...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002595679
Дата охранного документа: 27.08.2016
25.08.2017
№217.015.9eaf

Штамм вируса нодулярного дерматита крупного рогатого скота dermatitis nodularis bovum, рода capripoxvirus для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики нодулярного дерматита крупного рогатого скота

Изобретение относится к области ветеринарной вирусологии и биотехнологии и касается штамма вируса нодулярного дерматита крупного рогатого скота (ВНД КРС). Описанный штамм выделен от коров, больных нодулярным дерматитом, и депонирован в Коллекции штаммов микроорганизмов ФГБУ «ВНИИЗЖ» под...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002606254
Дата охранного документа: 10.01.2017
25.08.2017
№217.015.b528

Устройство для прессования порошков

Изобретение относится к технике прессования, в частности к устройствам двухстороннего прессования порошков, но преимущественно пористых материалов с малой насыпной плотностью, типа терморасширенного графита, для получения прутков, стержней различного диаметра и композиции, содержащей...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002614279
Дата охранного документа: 24.03.2017
29.12.2017
№217.015.fb3c

Тест-система ифа для серологической диагностики нодулярного дерматита крупного рогатого скота - dermatitis nodularis bovum

Изобретение относится к ветеринарной вирусологии и биотехнологии, в частности к созданию тест-системы ИФА с использованием вируса нодулярного дерматита крупного рогатого скота при разработке и производстве средств диагностики. Тест-система для серологической диагностики нодулярного дерматита...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002640192
Дата охранного документа: 26.12.2017
19.01.2018
№218.016.07f3

Способ лечения острого распространённого гнойного перитонита

Изобретение относится к медицине, а именно к хирургии. Выполняют внутрибрюшную санацию и кишечный перитонеально-интестинальный лаваж с использованием озона под контролем внутрибрюшного давления. При этом санацию брюшной полости проводят 1500-2000 мл озонированного физиологического раствора с...
Тип: Изобретение
Номер охранного документа: 0002631561
Дата охранного документа: 25.09.2017
+ добавить свой РИД