23.02.2020
220.018.04e2

Конъюгаты var2csa-лекарственное средство

Вид РИД

Изобретение

Юридическая информация Свернуть Развернуть
Краткое описание РИД Свернуть Развернуть
Аннотация: Изобретение относится к конъюгатам VAR2CSA-лекарственное средство, имеющим биологическую активность. Конъюгаты и фармацевтические композиции, содержащие такие конъюгаты, предназначены для применения в способе лечения рака. 3 н. и 19 з.п. ф-лы, 24 ил., 13 табл., 7 пр.
Реферат Свернуть Развернуть

ПЕРЕКРЕСТНАЯ ССЫЛКА НА РОДСТВЕННЫЕ ЗАЯВКИ

Настоящая заявка заявляет приоритет согласно 35 U.S.С. §119 (е) по предварительной заявке на патент США №61/921242, поданной 27 декабря 2013 года, предварительной заявке на патент США №62/051886, поданной 17 сентября 2014 года и предварительной заявке на патент США №62/051899, поданной 17 сентября 2014 года, полное содержание которых включено в данный документ посредством отсылки.

ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ

Изобретение относится к конъюгатам лекарственного средства, композициям, содержащим то же самое лекарственное средство, и способам применения таких конъюгатов лекарственного средства и композиций для лечения рака и других заболеваний.

УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ

Белок VAR2CSA

Протеогликаны представляют собой белки, конъюгированные с цепями гликозаминогликана (GAG). Эти белки распределяются внутри клетки, на клеточной мембране и во внеклеточном матриксе, выполняя различные функции: формирования хрящевой матрицы; структурной организации тканей; организации базальных мембран; регулирования роли секреторных везикул; связывания цитокинов, хемокинов, факторов роста и морфогенов; рецепторов протеазы и ингибиторов протеазы; корецепторов, рецепторов фактора роста тирозинкиназного типа; в качестве эндоцитических рецепторов; облегчения прикрепления клеток, межклеточных взаимодействий и подвижности клеток, а также миграции клеток.

Малярийный паразит Plasmodium falciparum применяет протеогликаны клетки-хозяина практически на всех этапах его сложного жизненного цикла. Спорозоит заражает гепатоциты в печени посредством экспрессирующегося на поверхности циркумспорозоитного белка, взаимодействующего с высокосульфатированными гепарансульфатпротеогликанами (HSPG). Инфекция на стадии мерозоитов эритроцитов медиируется с помощью связывания ЕВА-175 с сиаловой кислотой на гликофорине А. Кроме того, ряд белков Erythrocyte Membrane Protein 1 Plasmodium falciparum (PfEMP1), опосредующих эндотелиальную адгезию хозяина, были описаны как гликансвязывающие. Одним из них является VAR2CSA, который является уникальным членом семейства белков PfEMP1. VAR2CSA связывается с высоким сродством с отдельной формой хондроитинсульфата A (CSA), прикрепленной к протеогликанам, так называемому хондроитинсульфату протеогликану (CSPG), в межворсинчатых пространствах плаценты. Этот тип CSA называют CSA плацентарного типа (plCSA). VAR2CSA представляет собой крупный мультидоменный белок (350 кДа), экспрессируемый на поверхности инфицированных P. falciparum эритроцитов (IE), взаимодействие VAR2CSA-plCSA несет ответственность за специфическое по отношению к плаценте секвестрирование при плацентарной малярии (РМ). Важно отметить, что рекомбинантный полноразмерный эктодомен VAR2CSA от паразитов типа FCR3 и 3D7 показал сродство к plCSA в низком наномолярном диапазоне.

CSA относится к семейству гликозаминогликанов (GAG), которые являются линейными полимерами чередующихся остатков аминосахаров и аскорбиновой кислоты, прикрепленных к протеогликанам. Существуют несколько типов GAG, в том числе; хондроитинсульфат (CS), дерматансульфат (DS или CSB), гепарансульфат (HS) и гепарин. В то время как полисахаридный остов этих GAG является простым, значительное разнообразие возникает в модификациях, таких как сульфатирование и уронатная эпимеризация. Это является основой для широкого разнообразия в доменной структуре и биологических активностях различных GAG.

CS взаимодействует со многими важными факторами, такими как гормоны роста, цитокины, хемокины и молекулы адгезии и, как полагают, участвует в структурной стабилизации, цитокинезе, пролиферации клеток, дифференциации, миграции клеток, морфогенезе тканей, органогенезе, инфекции и заживлении ран. Цепи CS состоят из чередующихся единиц остатков N-ацетил-D-галактозамина (GalNAc) и глюкуроновой кислоты. Глюкуроновая кислота может быть сульфатирована по ее С2 положению, а GalNAc может быть сульфатирован по С4 и/или С6, образовывая различные фрагменты дисахаридов. Варьирование модификациями сахарного остова делает возможной структурную и функциональную разнородность цепей CS.

Хондроитинсульфат протеогликан 4 (CSPG4), также известный как высокомолекулярный ассоциированный с меланомой антиген (HMW-MAA) или ассоциированный с меланомой хондроитинсульфат протеогликан (MSCP), представляет собой протеогликан клеточной поверхности, который, как было показано, экспрессируется клетками миеломы. CSPG4/MSCP/HMW-MAA представляет собой большой протеогликан, характеризующийся наличием цепей CS на белковом остове.

VAR2CSA сохраняет свою способность связываться с высоким сродством и специфичностью с некоторыми хондроитинсульфат протеогликанами с минимальными структурными элементами последовательности полипептида. Коровый plCSA-связывающий сайт находится в пределах домена DBL2X, в том числе небольших частей фланкирующих междоменных областей. Связывание не зависит от области ID2b или от фланкирующих областей DBL1X или DBL3X, как предполагалось ранее. Минимальная связывающая область представляет собой ID1-DBL2Xb, который связывает CSPG с характеристиками, сравнимыми с полноразмерным VAR2CSA. Минимальная связывающая область ID1-DBL2Xb намного меньше полноразмерного VAR2CSA, имеет молекулярную массу только 62 кДа. Этот фрагмент VAR2CSA и другие полипептиды VAR2CSA связываются с высоким и специфическим сродством с раковыми клетками и тканями, это связывание предлагается как связывание посредством специфического взаимодействия с хондроитинсульфат протеогликанами, экспрессируемыми на поверхности раковых клеток или в окружающем внеклеточном матриксе (Salanti et al., WO 2013/117705). Соответственно, это специфическое и высокоаффинное связывание может быть применено для нацеливания раковых клеток или других тканей или клеток с высокой или иной экспрессией, такой как аномальная экспрессия, данного конкретного типа хондроитинсульфат протеогликана.

В области медицины существует потребность в стабильных конъюгатах белок-лекарственное средство, которые могут высвобождать биологически активные соединения селективно в желаемых целевых позициях, имеющих высокую, или иную аномальную экспрессию хондроитинсульфат протеогликанов. Данное изобретение удовлетворяет этим потребностям и обеспечивает дополнительные связанные с этим преимущества.

СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ

Вкратце, данное изобретение относится к биологически активным конъюгатам белок-лекарственное средство и способам применения таких конъюгатов белок-лекарственное средство. Предлагаемое представляет собой конъюгаты белок-лекарственное средство, которые представляют собой соединения Формулы I:

где:

Т представляет собой нацеливающую функциональную группу, содержащую полипептид VAR2CSA;

L-P выбран из: L1-P1 или L2-P2;

L1 представляет собой линкер или L1 отсутствует;

Р1 представляет собой моновалентный радикал соединения Формулы XIV

где:

R16 и R17 независимо выбраны из группы, состоящей из: Н и насыщенной или ненасыщенной функциональной группы, имеющей линейный, разветвленный или неароматический циклический скелет, содержащий от одного до десяти атомов углерода, и атомы углерода необязательно замещены с помощью: -ОН, -I, -Br, -Cl, -F, -CN, -CO2H, -СНО, -COSH или -NO2; или R17 и R20 являются конденсированными и образуют кольцо;

R18 и R19 независимо выбраны из группы, состоящей из: Н, R25 и ArR25- или R18 и R19 соединены с образованием кольца;

R20 выбран из группы, состоящей из: Н, R25, ArR25- и Ar; или R20 и R17 являются конденсированными и образуют кольцо;

R21 выбран из группы, состоящей из: Н, R25 и ArR25-;

R22 и R23 независимо выбраны из группы, состоящей из: Н, R25 и ArR25-;

R24 представляет собой: -Y-(CO)NHSO2-R26

R25 определен как насыщенная или ненасыщенная функциональная группа, имеющая линейный, разветвленный или неароматический циклический скелет, содержащий от одного до десяти атомов углерода, от нуля до четырех атомов азота, от нуля до четырех атомов кислорода и от нуля до четырех атомов серы, и атомы углерода необязательно замещены: =O, =S, ОН, -OR28, -O2CR28, -SH, -SR28, -SOCR28, -NH2, -NHR28, -N(R28)2, -NHCOR28, -NR28COR28, -I, -Br, -Cl, -F, -CN, -CO2H, -CO2R28, -CHO, -COR28, -CONH2, -CONHR28, -CON(R28)2, -COSH, -COSR28, -NO2, -SO3H, -SOR28, -SO2R28, где R28 представляет собой линейную, разветвленную или циклическую, из от одного до десяти атомов углерода насыщенную или ненасыщенную алкильную группу;

кольцо, образованное путем присоединения R18 и R19, представляет собой 3-7-членный неароматический циклический скелет в рамках определения R25,

Y определен как функциональная группа, выбранная из группы, состоящей из: линейной, насыщенной или ненасыщенной, алкильной группы из от одного до шести атомов углерода, необязательно замещенной с помощью R25, ArR25- или X; и

X определен как функциональная группа, выбранная из группы, состоящей из: -ОН, -OR25, =O, =S, -O2CR25, -SH, -SR25, -SOCR25, -NH2, -NHR25, -N(R25)2, -NHCOR25, -NRCOR25, -I, -Br, -Cl, -F, -CN, -CO2H, -CO2R25, -CHO, -COR25, -CONH2, -CONHR25, -CON(R25)2, -COSH, -COSR25, -NO2, -SO3H, -SOR25 и -SO2R25;

R26 выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного алкила, необязательно замещенного алкиламино, необязательно замещенного циклоалкила, необязательно замещенного арила, необязательно замещенного гетероциклила, необязательно замещенного гетероарила, -COR27, -CSR27, -OR27 и -NHR27, где каждый R27 представляет собой, независимо, необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкиламино, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный арил, необязательно замещенный гетероциклил или необязательно замещенный гетероарил; и

L2 представляет собой линкер или L2 отсутствует;

Р2 представляет собой биологически активное соединение; и

L2-P2 имеет следующую структуру (III):

где:

R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного алкила, необязательно замещенного алкиламино, необязательно замещенного циклоалкила, необязательно замещенного арила, необязательно замещенного гетероциклила, необязательно замещенного гетероарила, -COR27 -CSR27, -OR27 и -NHR27, где каждый R27 представляет собой, независимо, необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкиламино, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный арил, необязательно замещенный гетероциклил или необязательно замещенный гетероарил или R отсутствует;

Р3 представляет собой оставшуюся часть соединения Р2; и

L3 необязательно представляет собой оставшуюся часть линкера L2, при условии, что присутствует L2.

В предпочтительном варианте реализации изобретения R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного алкила, необязательно замещенного алкиламино, необязательно замещенного циклоалкила, необязательно замещенного арила, необязательно замещенного гетероциклила и необязательно замещенного гетероарила, или R отсутствует.

В другом варианте реализации изобретения предлагается способ применения в терапии соединения Формулы I. В частности, данное описание предлагает способ лечения рака у млекопитающего, включающий введение нуждающемуся в этом млекопитающему эффективного количества соединения Формулы I или фармацевтической композиции, содержащей соединение Формулы I и фармацевтически приемлемый носитель, разбавитель или вспомогательное средство.

В другом варианте реализации изобретения данное описание предлагает способ ингибирования роста опухоли у млекопитающего, включающий введение нуждающемуся в этом млекопитающему эффективное количество соединения Формулы I или фармацевтической композиции, содержащей соединение Формулы I и фармацевтически приемлемый носитель, разбавитель или вспомогательное вещество.

В другом варианте реализации изобретения данное описание предлагает способ лизиса раковых клеток in vitro с применением соединения конструкции. В другом варианте реализации изобретения данное описание предлагает способ лизиса раковых клеток in vivo у млекопитающего, включающий введение нуждающемуся в этом млекопитающему эффективного количества соединения Формулы I или фармацевтической композиции, содержащей соединение Формулы I и фармацевтически приемлемый носитель, разбавитель или вспомогательное вещество.

Эти и другие аспекты изобретения будут очевидны при ссылке на следующее подробное описание.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙ

Фигура 1 иллюстрирует обобщенные данные цитотоксичности (ЕС50) для каждого из соединений А-Е в случае двух клеточных линий (НСС1954 и Jurkat)

Фигура 2 иллюстрирует графическое представление данных цитотоксичности в случае соединения А на двух клеточных линиях (НСС1954 и Jurkat)

Фигура 3 иллюстрирует графическое представление данных цитотоксичности в случае соединения В на двух клеточных линиях (НСС1954 и Jurkat).

Фигура 4 иллюстрирует графическое представление данных цитотоксичности в случае соединения С на двух клеточных линиях (НСС1954 и Jurkat).

Фигура 5 иллюстрирует графическое представление данных цитотоксичности в случае соединения D на двух клеточных линиях (НСС1954 и Jurkat).

Фигура 6 иллюстрирует графическое представление данных цитотоксичности в случае соединения Е на двух клеточных линиях (НСС1954 и Jurkat).

Фигура 7 иллюстрирует in vivo результаты введения Соединения F, Соединения 14 или Соединения 23 на объем опухоли у самок бестимусных мышей с мутацией по гену nude с развившимися опухолями

Фигура 8: иллюстрирует обработанную с помощью MaxEnt1 SEC-СВЭЖХ-QTof-МС интактную массу VAR2-соединение О. Сигналы MS при 115323 Да, 117662 Да и 119999 Да согласуются с конъюгацией 1, 3 и 5 токсинов, со средним уровнем конъюгации ~4 токсина на белок.

Фигура 9 иллюстрирует: обработанную с помощью MaxEnt1 SEC-СВЭЖХ-QTof-МС интактную массу VAR2-Соединение KK. Профайл восстановленных из свертки данных MS согласуется с конъюгацией вплоть до 5 токсинов (Соединение KK), но со средним содержанием лекарственного средства ~2,5 лекарственных средств.

Фигура 10 иллюстрирует анализ свободного неконъюгированного токсин-линкер в получении конъюгата VAR2CSA-лекарственное средство. Ось X: Время. Ось Y: Интенсивность. Линии (основанные на уменьшении высоты вершины) соответствуют 20 нМ лекарственного средства-линкера, 10 нМ лекарственного средства-линкера, 1 нМ лекарственного средства-линкера, 0,5 нМ лекарственного средства-линкера и аналита.

Фигура 11 иллюстрирует специфику связывания немодифицированных DBL1-ID2a (МР1255) с клеточной линией Myla2059 в присутствие или отсутствие CSA (Sigma С9819).

Фигура 12 иллюстрирует специфику связывания VAR2-Соединение О (конъюгат цистеина) с клеточной линией Myla2059 в присутствие или отсутствие CSA (Sigma С9819).

Фигура 13 иллюстрирует специфику связывания VAR2-Соединение KK (конъюгат лизина) с клеточной линией Myla2059 в присутствие или отсутствие CSA (Sigma С9819).

Фигура 14 иллюстрирует цитотоксичность конъюгата VAR2CSA-лекарственное средство по отношению к клеткам Colo205. Применяемый белок VAR2 представлял собой DBL1-ID2a. VAR2-Соединение О - круги. VAR2-Соединение О с добавлением CSA (Sigma С9819) - ромбы. Отдельно CSA - квадраты.

Фигура 15 иллюстрирует цитотоксичность конъюгатов VAR2CSA-лекарственное средство по отношению к клеткам Colo205. VAR2-Соединение О, полученное с помощью конъюгации с цистеином - треугольники. VAR2-Соединение KK, полученное с помощью конъюгации с лизином - круги.

Фигура 16 иллюстрирует цитотоксичность конъюгатов VAR2CSA-лекарственное средство по отношению к клеткам Colo205. VAR2-Соединение О - круги. Отдельно токсин-линкер - квадраты.

Фигура 17 иллюстрирует цитотоксичность конъюгатов VAR2CSA-лекарственное средство по отношению к клеткам UM-UC 3. VAR2-Соединение О - круги. Отдельно VAR2CSA - ромбы.

Фигура 18 иллюстрирует цитотоксичность конъюгатов VAR2CSA-лекарственное средство по отношению к клеткам U138 MG. VAR2-Соединение О - круги. Отдельно VAR2CSA - ромбы.

Фигура 19 иллюстрирует цитотоксичность конъюгатов VAR2CSA-лекарственное средство по отношению к клеткам OVCAR-3. VAR2-Соединение О - круги. Отдельно VAR2CSA - ромбы.

Фигура 20 иллюстрирует массы тел мышей в исследовании переносимости VAR2-Соединение О.

Фигура 21 иллюстрирует массы тел мышей в исследовании эффективности ксенотрансплантанта Karpas 299 после трех IV доз исследуемых соединений.

Фигура 22 иллюстрирует объемы опухолей мышей в исследовании эффективности ксенотрансплантанта Karpas 299 после трех IV доз исследуемых соединений.

Фигура 23 иллюстрирует массы тел мышей в исследовании эффективности рака простаты РС3.

Фигура 24 иллюстрирует объемы опухолей мышей в исследовании эффективности рака простаты РС3.

ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ

В следующем описании некоторые конкретные детали изложены для того, чтобы обеспечить полное понимание различных вариантов реализации изобретения. Тем не менее, специалисту в данной области техники будет понятно, что изобретение может быть осуществлено на практике без этих деталей.

ОПРЕДЕЛЕНИЯ

Если не указано иное, следующие термины и фразы, как применяют в данном документе, предназначены для того, чтобы иметь следующие значения. Если в данном документе применяют торговые наименования, заявители намерены независимо включать состав продукта торгового наименования, дженериковое лекарственное средство и активный фармацевтический ингредиент(ы) продукта торгового наименования.

Если контекст не требует иного, во всем описании и формуле изобретения, слово "содержать" и его вариации, такие как "содержит" и "содержащий", должны толковаться в открытом, всеобъемлющем смысле, то есть как "в том числе, но не ограничиваясь этим".

Ссылка в данном описании на "отдельный вариант реализации изобретения" или "вариант реализации изобретения" означает, что конкретный признак, структура или характеристика, описанные в связи с вариантом реализации изобретения, включены в по меньшей мере один из вариантов данного описания. Таким образом, появления фраз, таких как "в одном варианте реализации изобретения" или "в варианте реализации изобретения" в различных местах по всему данному описанию не обязательно относится все к тому же варианту реализации изобретения. Следует понимать, что некоторые признаки, описанные в данном документе, которые для ясности описаны в контексте отдельных вариантов реализации данного изобретения, также могут быть представлены в комбинации в одном варианте реализации настоящего изобретения. Наоборот, различные признаки, описанные в данном документе, которые для краткости описаны в контексте отдельного варианта реализации изобретения, также могут быть представлены отдельно или в любой подходящей подкомбинации.

Химические группы

Все комбинации вариантов реализации изобретения, относящиеся к химическим группам, представленным переменными (например, R1-R50, Q, X, Y и Z), содержащимися в общих химических формулах, описанных в данном документе (например, II, XIV, XV и XX), специально охватываются данным изобретением так же, как если бы каждая комбинация была по отдельности процитирована в явном виде, в той степени, что такие комбинации охватывают соединения, которые приводят к получению стабильных соединений (т.е., соединения, которые могут быть выделены, охарактеризованы и исследованы на биологическую активность). Кроме того, все подкомбинации химических групп, перечисленных в вариантах реализации изобретения, описывающих такие переменных, а также все подкомбинации применения и медицинских показаний, описанных в данном документе, также конкретно охватываются данным изобретением так же, как если бы каждая субкомбинация химических групп и подкомбинация применений и медицинских показаний были по отдельности и в явном виде изложены в данном документе. Кроме того, в случае, если список заместителей указан для любой конкретной переменной (например, R1-R50, Q, X, Y и Z) в конкретном варианте реализации изобретения и/или пункте формулы изобретения, следует понимать, что каждый отдельный заместитель может быть удален из конкретного варианта реализации изобретения и/или пункта формулы изобретения и что оставшийся список заместителей будет рассматриваться в пределах данного описания.

Термин "ацилокси", как применяют в данном документе, включает -ОС(O)-алкил, где алкил является таким, как определено в данном документе. Примеры ацилокси включают, но без ограничения этим: формилокси, ацетокси, пропионилокси, изобутирилокси, пивалоилокси и тому подобное.

Термин "ацилтио", как применяют в данном документе, соответствует -SC(O)-алкилу, где алкил является таким, как определено в данном документе. Примеры ацилтио включают, но без ограничения этим: формилтио, ацетилтио, пропионилтио, изобутирилтио, пивалоилтио и тому подобное.

Термин "алкоксикарбонил", как применяют в данном документе, соответствует -С(O)O-алкилу. Примеры алкоксикарбонила включают, но без ограничения этим: метоксикарбонил, этоксикарбонил, н-пропоксикарбонил, изопропоксикарбонил, н-бутоксикарбонил, втор-бутоксикарбонил, изобутоксикарбонил, трет-бутоксикарбонил, пентилоксикарбонил, изопентилоксикарбонил, трет-пентилоксикарбонил, нео-пентилоксикарбонил, 1-метилбутоксикарбонил, 2-метилбутоксикарбонил, н-гексилоксикарбонил и тому подобное.

"Алкил" соответствует прямой или разветвленной углеводородной цепи, состоящей исключительно из атомов углерода и водорода, которая является насыщенной или ненасыщенной (т.е., содержит одну или более двойных и/или тройных связей), имеющей от одного до двенадцати атомов углерода (С112 алкил), предпочтительно, от одного до восьми атомов углерода (C1-C8 алкил) или от одного до шести атомов углерода (C16 алкил), и которая прикреплена к остальной части молекулы с помощью одинарной связи, например, метил, этил, н-пропил, 1-метилэтил (изо-пропил), н-бутил, н-пентил, 1,1-диметилэтил (трет-бутил), 3-метилгексил, 2-метилгексил, этенил, проп-1-енил, бут-1-енил, пент-1-енил, пента-1,4-диенил, этинил, пропинил, бутинил, пентинил, гексинил и тому подобное. Если в описании конкретно не указано иное, алкильная группа может быть необязательно замещена.

"Алкилен", "алкиленовая цепь" или "алкилдиил" соответствует прямой или разветвленной двухвалентной углеводородной цепи, связывающей остаток молекулы с замещающей группой, состоящей исключительно из атомов углерода и водорода, которая является насыщенной или ненасыщенной (т.е., содержит одну или более двойных и/или тройных связей), и имеющей от одного до двенадцати атомов углерода, например, метилен, этилен, пропилен, н-бутилен, этенилен, пропенилен, н-бутенилен, пропинилен, н-бутинилен и тому подобное. Алкиленовая цепь прикреплена к остальной части молекулы посредством одинарной или двойной связи, а к замещающей группе посредством одинарной или двойной связи. Точки прикрепления алкиленовой цепи к остальной части молекулы и к замещающей группе может иметь вид одного атома углерода или любых двух атомов углерода в цепи. Если в описании конкретно не указано иное, алкиленовая цепь может быть необязательно замещена.

Термин "алкенилдиил", как применяют в данном документе, соответствует прямому или разветвленному ненасыщенному углеводородному бирадикалу, содержащему указанное количество атомов углерода и одну или более углерод-углеродных двойных связей, например, С26 алкенилдиил, С24 алкенилдиил или С2 алкенилдиил. Примеры алкенилдиила включают, но без ограничения этим: этенилдиил, н-пропенилдиил, изопропенилдиил, н-бутенилдиил, втор-бутенилдиил, изобутенилдиил, трет-бутенилдиил, пентенилдиил, изопентенилдиил, трет-пентенилдиил, нео-пентенилдиил, 1-метилбутенилдиил, 2-метилбутенилдиил, н-гексенилдиил и тому подобное.

"Алкокси" соответствует заместителю формулы -ORa, где Ra представляет собой алкильный заместитель, как определено выше, содержащий от одного до двенадцати атомов углерода. Если в описании конкретно не указано иное, алкокси группа может быть необязательно замещена.

"Алкиламино" соответствует заместителю формулы -NHRa или -NRaRa, где каждый Ra представляет собой независимо алкильный заместитель, как определено выше, содержащий от одного до двенадцати атомов углерода. Если в описании конкретно не указано иное, алкиламино группа может быть необязательно замещена.

"Амино" соответствует заместителю -NH2.

Термин "аминоциклоалкил", как применяют в данном документе, соответствует циклоалкильной группе, замещенной одним аминозаместителем, таким образом, как эти термины определены в данном документе. Примеры аминоциклоалкила включают, но без ограничения этим: аминоциклопропил, аминоциклобутил, аминоциклопентил, аминоциклогексил и тому подобное.

Термин "аминоалкил", как применяют в данном документе, соответствует алкильной группе, замещенной одним аминозаместителем, таким образом, как эти термины определены в данном документе. Примеры аминоалкила включают, но без ограничения этим: аминометил, аминоэтил, амино-н-пропил, амино-изопропил, амино-н-бутил, амино-втор-бутил, аминоизобутил, амино-трет-бутил, аминопентил, аминоизопентил, амино-трет-пентил, амино-нео-пентил, амино-1-метилбутил, амино-2-метилбутил, амино-н-гексил и тому подобное.

Термин "аминоарил", как применяют в данном документе, соответствует арильной группе, замещенной одним аминозаместителем, таким образом, как эти термины определены в данном документе. Примеры аминоарила включают, но без ограничения этим: аминофенил, аминонафталенил и тому подобное.

"Арил" соответствует заместителю на основе углеводородной кольцевой системе, содержащей водород, от 6 до 18 атомов углерода и по меньшей мере одно ароматическое кольцо. Для целей данного описания арильный заместитель может быть моноциклической, бициклической, трициклической или тетрациклической кольцевой системой, которая может содержать конденсированные или мостиковые кольцевые системы. Арильные заместители включают, но без ограничения этим, арильные заместители, полученные из ацеантрилена, аценафтилена, ацефенантрилена, антрацена, азулена, бензола, хризена, флуорантена, флуорену, ассим-индацена, сим-индацена, индана, индена, нафталина, феналена, фенантрена, плеядена, пирена и трифенилена. Если в описании конкретно не указано иное, термин "арил" или префикс "ар-" (такой, как в "аралкил") предназначен для включения арильных заместителей, которые являются необязательно замещенными.

"Аралкил" соответствует заместителю формулы -Rb-Rc, где Rb представляет собой алкиленовую цепь, как определено выше, и Rc представляет собой один или более арильных заместителей, как определено выше, например, бензил, дифенилметил и тому подобное. Если в описании конкретно не указано иное, аралкильная группа может быть необязательно замещена.

Термин "карбоксамид", как применяют в данном документе, соответствует -C(O)NH2.

Термин "карбоксил", как применяют в данном документе, соответствует -С(O)ОН.

"Циано" соответствует заместителю -CN.

"Циклоалкил" или "карбоциклическое кольцо" соответствует стабильному неароматическому моноциклическому или полициклическому углеводородному заместителю, состоящему исключительно из атомов углерода и атомов водорода, который может включать конденсированные или мостиковые кольцевые системы, имеющие от трех до пятнадцати атомов углерода, предпочтительно, имеющие от трех до десяти атомов углерода, и который насыщен или ненасыщен и прикреплен к остальной части молекулы одинарной связью. Моноциклические радикалы включают, например, циклопропил, циклобутил, циклопентил, циклогексил, циклогептил и циклооктил. Полициклические заместители содержат, например, адамантил, норборнил, декалинил, 7,7-диметил-бицикло[2.2.1]гептанил и тому подобное. Если в описании конкретно не указано иное, циклоалкильная группа может быть необязательно замещена.

"Циклоалкилалкил" соответствует заместителю формулы -RbRd где Rd представляет собой алкиленовую цепь, как определено выше и Rg представляет собой циклоалкильный заместитель, как определено выше. Если в описании конкретно не указано иное, циклоалкилалкильная группа может быть необязательно замещена.

"Конденсированный" соответствует любой кольцевой структуре, описанной в данном документе, которая конденсирована с существующей кольцевой структурой в соединениях по данному описанию. При условии, что конденсированное кольцо является гетероциклильным кольцом или гетероарильным кольцом, любой атом углерода существующей кольцевой структуры, которая становится частью слитого гетероциклильного кольца или конденсированного гетероарильного кольца, может быть заменен на атом азота.

"Галогено" или "галоген" соответствует брому, хлору, фтору или йоду.

"Галогеналкил" соответствует алкильному радикалу, как определено выше, который замещен одним или более галогенными заместителями, как определено выше, например, трифторметилом, дифторметилом, трихлорметилом, 2,2,2-трифторэтилом, 1,2-дифторэтилом, 3-бром-2-фторпропилом, 1,2-дибромэтилом и тому подобное. Если в описании конкретно не указано иное, галогеналкильная группа может быть необязательно замещена.

Термин "галогеналкокси", как применяют в данном документе, соответствует -О-галогеналкилу, причем галогеналкил является таким, как определено в данном документе. Примеры галогеналкокси включают, но без ограничения этим: дифторметокси, трифторметокси, 2,2,2-трифторэтокси, пентафторэтокси и тому подобное.

"Гетероарил" соответствует заместителю на основе 5-14-членной кольцевой системы, содержащему атомы водорода, от одного до тринадцати атомов углерода, от одного до шести гетероатомов, выбранных из группы, состоящей из азота, кислорода и серы, а также по меньшей мере одного ароматического кольца. Для целей данного описания, гетероарильный заместитель может быть моноциклической, бициклической, трициклической или тетрациклической кольцевой системой, которая может содержать конденсированные или мостиковые кольцевые системы; и атомы азота, углерода или серы в гетероарильном заместителе могут быть необязательно окислены; при этом атом азота может быть необязательно кватернизирован. Примеры включают, но без ограничения этим, азепинил, акридинил, бензимидазолил, бензотиазолил, бензиндолил, бензодиоксолил, бензофуранил, бензоксазолил, бензотиазолил, бензотиадиазолил, бензо[b][1,4]диоксипенил, 1,4-бензодиоксанил, бензонафтофуранил, бензоксазолил, бензодиоксолил, бензодиоксинил, бензопиранил, бензопиранонил, бензофуранил, бензофуранонил, бензотиенил (бензотиофенил), бензотриазолил, бензо[4,6]имидазо[1,2-а]пиридинил, карбазолил, циннолинил, дибензофуранил, дибензотиофенил, фуранил, фуранонил, изотиазолил, имидазолил, индазолил, индолил, индазолил, изоиндолил, индолинил, изоиндолинил, изохинолил, индолизинил, изоксазолил, нафтиридинил, оксадиазолил, 2-оксоазепинил, оксазолил, оксиранил, 1-оксидопиридинил, 1-оксидопиримидинил, 1-оксидопиразинил, 1-оксидопиридазинил, 1-фенил-1H-пирролил, феназинил, фенотиазинил, феноксазинил, фталазинил, птеридинил, пуринил, пирролил, пиразолил, пиридинил, пиразинил, пиримидинил, пиридазинил, хиназолинил, хиноксалинил, хинолинил, хинуклидинил, изохинолинил, тетрагидрохинолинил, тиазолил, тиадиазолил, триазолил, тетразолил, триазинил и тиофенил (т.е. тиенил). Если в описании конкретно не указано иное, гетероарильная группа может быть необязательно замещена.

"N-гетероарил" соответствует гетероарильному заместителю, как определено выше, содержащему по меньшей мере один атом азота, и где точка прикрепления гетероарильного заместителя к остальной части молекулы имеет вид атома азота в гетероарильном заместителе. Если в описании конкретно не указано иное, N-гетероарильная группа может быть необязательно замещена.

"Гетероарилалкил" соответствует заместителю формулы -RbRf, где Rb представляет собой алкиленовую цепь, как определено выше, и Rf представляет собой гетероарильный заместитель, как определено выше. Если в описании конкретно не указано иное, гетероарилалкильная группа может быть необязательно замещена.

Термин "гетероарилдиил", как применяют в данном документе, соответствует бивалентный радикал, полученный из 6-12-членной моно- или бициклической кольцевой системы, в которой по меньшей мере один кольцевой атом представляет собой гетероатом и по меньшей мере одно кольцо является ароматическим. Примеры гетероатома включают, но без ограничения этим: О, S, N и тому подобное. Примеры гетероарилдиила включают, но без ограничения этим: тиазолилдиил, 2,4-тиазолилдиил, триазолилдиил, 1,2,3-триазолил-1,4-диил, пиридилдиил, бензофуранилдиил, пиразинилдиил, пиридазинилдиил, пиримидинилдиил, триазинилдиил, хинолинилдиил, бензоксазолилдиил, бензотиазолилдиил, 1H-бензимидазолилдиил, изохинолинилдиил, хиназолинилдиил, хиноксалинилдиил, пирролилдиил, индолилдиил, 1H-бензоимидазол-2-илдиил, бензо[1,3]диоксол-5-илдиил, 3,4-дигидро-2H-бензо[1,4]оксазин-7-илдиил, 2,3-дигидро-бензофуран-7-илдиил, 2,3-дигидро-индол-1-илдиил и тому подобное. Примеры включают, но без ограничения этим, и тому подобное.

"Гетероциклил" или "гетероциклическое кольцо" соответствует стабильному 3--18-членному не-ароматическому кольцевому заместителю, который состоит из от двух до двенадцати атомов углерода и от одного до шести гетероатомов, выбранных из группы, состоящей из азота, кислорода и серы. Если в описании конкретно не указано иное, гетероциклильный заместитель может быть моноциклической, бициклической, трициклической или тетрациклической кольцевой системой, которая может содержать конденсированные или мостиковые кольцевые системы; и атомы азота, углерода или серы в гетероциклильном заместителе могут быть необязательно окислены; при этом атом азота может быть необязательно кватернизирован; и гетероциклильный заместитель может быть частично или полностью насыщенным. Примеры подобных гетероциклильных радикалов включают, но не ограничиваясь этим, диоксоланил, тиенил[1,3]дитианил, декагидроизохинолил, имидазолинил, имидазолидинил, изотиазолидинил, изоксазолидинил, морфолинил, октагидроиндолил, октагидроизоиндолил, 2-оксопиперазинил, 2-оксопиперидинил, 2-оксопирролидинил, оксазолидинил, пиперидинил, пиперазинил, 4-пиперидонил, пирролидинил, пиразолидинил, хинуклидинил, тиазолидинил, тетрагидрофурил, тритианил, тетрагидропиранил, тиоморфолинил, тиаморфолинил, 1-оксо-тиоморфолинил и 1,1-диоксо-тиоморфолинил. Если в описании конкретно не указано иное, гетероциклильная группа может быть необязательно замещена.

"N-гетероциклил" соответствует гетероциклильному заместителю, как определено выше, содержащему по меньшей мере один атом азота, и где точка прикрепления гетероциклильного заместителя к остальной части молекулы имеет вид атома азота в гетероциклильном заместителе. Если в описании конкретно не указано иное, N-гетероциклильная группа может быть необязательно замещена.

"Гетероциклилалкил" соответствует заместителю формулы -RbRe, где Rb представляет собой алкиленовую цепь, как определено выше, и Re представляет собой гетероциклильный заместитель, как определено выше, и если гетероциклил представляет собой азотсодержащий гетероциклил, гетероциклил может быть прикреплен к алкильному заместителю на атоме азота. Если в описании конкретно не указано иное, гетероциклилалкильная группа может быть необязательно замещена.

Термин "гетероциклилдиил", как применяют в данном документе, соответствует бивалентному радикалу, полученному из 3-12-членной моно- или бициклической неароматической кольцевой системы, в которой по меньшей мере один кольцевой атом представляет собой гетероатом. Примеры гетероатома включают, но без ограничения этим: О, S, N и тому подобное. Гетероциклилдиильный заместитель может быть прикреплен с помощью любых двух из имеющихся кольцевых атомов, например, кольцевыми атомами углерода или кольцевыми атомами азота. В некоторых вариантах реализации изобретения гетероциклилдиил представляет собой содержащее 3, 4, 5, 6 или 7 членов кольцо. Примеры гетероциклилдиильной группы включают, но без ограничения этим: азиридин-1-илдиил, азиридин-2-илдиил, азетидин-1-илдиил, азетидин-2-илдиил, азетидин-3-илдиил, пиперидин-1-илдиил, пиперидин-2-илдиил, пиперидин-3-илдиил, пиперидин-4-илдиил, морфолин-2-илдиил, морфолин-3-илдиил, морфолин-4-илдиил, пиперазин-1-илдиил, пиперазин-2-илдиил, пиперазин-3-илдиил, пиперазин-4-илдиил, пирролидин-1-илдиил, пирролидин-2-илдиил, пирролидин-3-илдиил, [1,3]-диоксолан-2-илдиил, тиоморфолин-4-илдиил, [1,4]оксазепан-4-илдиил, 1,1-диоксо-1λ6-тиоморфолин-4-илдиил, азепан-1-илдиил, азепан-2-илдиил, азепан-3-илдиил, азепан-4-илдиил, октагидрохинолин-1-илдиил, октагидроизохинолин-2-илдиил и тому подобное.

"Гидрокси" или "гидроксил" соответствует заместителю -ОН.

Термин "гидроксиалкил", как применяют в данном документе, соответствует алкильной группе, замещенной одним гидроксизаместителем, таким образом, как эти термины определены в данном документе. Примеры гидроксиалкила включают, но без ограничения этим: гидроксиметил, гидроксиэтил, гидрокси-н-пропил, гидроксиизопропил, гидрокси-н-бутил, гидрокси-втор-бутил, гидроксиизобутил, гидрокси-трет-бутил, гидроксипентил, гидроксиизопентил, гидрокси-трет-пентил, гидрокси-нео-пентил, гидрокси-1-метилбутил, гидрокси-2-метилбутил, гидрокси-н-гексил и тому подобное.

"Имино" соответствует заместителю =NH.

"Тиоалкил" соответствует заместителю формулы -SRa, где Ra представляет собой алкильный заместитель, как определено выше, содержащий от одного до двенадцати атомов углерода. Если в описании конкретно не указано иное, тиоалкильная группа может быть необязательно замещена.

"Нитро" соответствует заместителю -NO2.

"Оксо" соответствует заместителю =O.

"Тиол" соответствует заместителю -SH.

"Тиоксо" соответствует заместителю =S.

Термин "замещенный", применяемый в данном документе, означает любую из вышеперечисленных групп (т.е., алкил, алкилен, алкокси, алкиламино, тиоалкил, арил, аралкил, циклоалкил, циклоалкилалкил, галогеналкил, гетероциклил, N-гетероциклил, гетероциклилалкил, гетероарил, N-гетероарил и/или гетероарилалкил), где по меньшей мере один атом водорода замещен на связь с неводородными атомами, такими как, но не ограничиваясь этим: атом галогена, такой как F, Cl, Br и I; атом кислорода в группе, такой как гидроксильные группы, алкоксильные группы и сложноэфирные группы; атом серы в группах, таких как тиольные группы, тиоалкильные группы, сульфонные группы, сульфонильные группы и сульфоксидные группы; атом азота в группах, таких как азиды, амины, амиды, алкиламины, диалкиламины, ариламины, алкилариламины, диариламины, N-оксиды, имиды, глицины и енамины; атом кремния в группах, таких как триалкилсилильные группы, диалкиларилсилильные группы, алкилдиарилсилильные группы и триарилсилильные группы; и другие гетероатомы в других различных группах. "Замещенный" также означает любую из вышеуказанных групп, в которых один или более атомов водорода заменен на связь более высокого порядка (например, двойную или тройную связь) с гетероатомом, таким как кислород в оксо, карбониле, карбоксиле и сложноэфирных группах; и азот в группах, таких как имины, оксимы, гидразоны и нитрилы. Например, "замещенный" включает любые из вышеуказанных групп, в которых один или несколько атомов водорода замещены -NRgRh, -NRgC(=O)Rh, -NRgC(=O)NRgRh, -NRgC(=O)ORh, -NRgC(=NRg)NRgRh, -NRgSO2Rh, -OC(=O)NRgRh, -ORg, -SRg, -SORg, -SO2Rg, -OSO2Rg, -SO2ORg, =NSO2Rg и -SO2NRgRh. "Замещенный также означает любую из указанных выше групп, в которых один или несколько атомов водорода замещены -C(=O)Rg, -C(=O)ORg, -C(=O)NRgRh, -CH2SO2Rg, -CH2SO2NRgRh. В изложенном выше, Rg и Rh являются одинаковыми или различными и независимо друг от друга представляют собой водород, алкил, алкокси, алкиламино, тиоалкил, арил, аралкил, циклоалкил, циклоалкилалкил, галогеналкил, гетероциклил, N-гетероциклил, гетероциклилалкил, гетероарил, N-гетероарил и/или гетероарилалкил. "Замещенный" дополнительно означает любую из вышеуказанных групп, в которых один или более атомов водорода замещен на связь с амино, циано, гидроксильной, имино, нитро, оксо, тиоксо, галогенной, алкильной, алкокси, алкиламино, тиоалкильной, арильной, аралкильной, циклоалкильной, циклоалкильной, галогеналкильной, гетероциклильной, N-гетероциклильной, гетероциклилалкильной, гетероарильной, N-гетероарильной и/или гетероарилалкильной группой. Кроме того, каждый из вышеуказанных заместителей может быть необязательно замещен одним или более из вышеперечисленных заместителей.

Данное описание также предназначено для того, чтобы охватывать все фармацевтически приемлемые соединения Формулы I, которые являются меченными изотопами, при этом один или более атомов замещены атомом, имеющим другую атомную массу или массовое число. Примеры изотопов, которые могут быть введены в описанные соединения, включают изотопы водорода, углерода, азота, кислорода, фосфора, фтора, хлора и йода, такие как 2Н, 3Н, 11С, 13С, 14С, 13N, 15N, 15O, 17O, 18O, 31Р, 32Р, 35S, 18F, 36Cl, 123I и 125I, соответственно. Эти меченные радиоактивным изотопом соединения являются применимыми для того, чтобы помочь определить или измерить эффективность соединений, с помощью исследования, например, сайта, режима действия или аффинности связывания с фармакологически важным сайтом действия. Некоторые меченные изотопами соединения, описанные в данном документе, например, те, которые включают радиоактивный изотоп, являются применимыми в исследованиях распределения в тканях лекарственного средства и/или субстрата. Радиоактивный изотоп тритий, т.е. 3Н, и углерод-14, т.е. 14С, являются особенно применимыми для этой цели ввиду легкости их введения и готовых способов обнаружения.

Замещение тяжелыми изотопами, такими как дейтерий, т.е. 2Н, может давать некоторые терапевтические преимущества в результате более высокой метаболической стабильности, например, повышенное in vivo время полужизни или сниженные требования к дозировки, и, следовательно, при некоторых обстоятельствах может быть предпочтительным.

Замещение излучающими позитрон изотопами, такими как 11С, 18F, 15O и 13N, может быть применимым в исследованиях с помощью позитронно-эмиссионной томографии (ПЭТ) для изучения степени занятости рецептора субстратом. Меченные изотопами соединения, описанные в данном документе, обычно могут быть получены стандартными способами, известными специалистам в этой области техники, или способами, аналогичными способам, описанным в Получениях и Примерах, как изложено ниже, с применением соответствующего меченного изотопами реагента вместо немеченного реагента, применяемого ранее.

Данное описание также предназначено для того, чтобы охватывать in vivo продуктов метаболизма, описанных соединений. Такие продукты могут быть результатом, например, окисления, восстановления, гидролиза, амидирования, эстерификации и тому подобного, введенного соединение, в первую очередь за счет ферментативных способов. Соответственно, данное описание включает соединения, полученные по способу, включающему введение соединения по данному описанию млекопитающему в течение периода времени, достаточного для получения его метаболического продукта. Такие продукты, как правило, идентифицируют путем введения меченного радиоактивным изотопом соединения по данному описанию в детектируемой дозе животному, такому как крыса, мышь, морская свинки, обезьяна или человек, что дает достаточное время для того, чтобы происходил обмен веществ и выделение его продуктов преобразования из мочи, крови или других биологических образцов.

Соединения по данному описанию, или их фармацевтически приемлемые соли могут содержать один или несколько асимметрических центров и могут, таким образом, приводить к энантиомерам, диастереомерам и другим стереоизомерным формам, которые могут быть определены в терминах абсолютной стереохимии как (R)- или (S)- или как (D)- или (L)- в случае аминокислот. Данное описание подразумевает включение всех таких возможных изомеров, а также их рацемических и оптически чистых форм. Оптически активные (+) и (-), (R)- и (S)- или (D)- и (L)-изомеры могут быть получены с применением хиральных синтонов или хиральных реагентов, или разделены с применением традиционных технологий, например, хроматографии и фракционной кристаллизации. Традиционные способы получения/выделения индивидуальных энантиомеров включают хиральный синтез из подходящего оптически чистого прекурсора или разделение рацемата (или рацемата соли или производного) с применением, например, хиральной жидкостной хроматографии высокого давления (ВЭЖХ). При условии, что соединения, описанные в данном документе, содержат олефиновые двойные связи или другие центры геометрической асимметрии и если не указано иное, предполагается, что соединения включают и Е, и Z геометрические изомеры. Таким же образом, также должны быть включены все таутомерные формы.

Другие определения

Термин "аминокислота" или "аминокислотный остаток", как применяют в данном документе, включает любую из двадцати встречающихся в природе аминокислот, D-форму любой из встречающихся в природе аминокислот, не встречающиеся в природе аминокислоты, а также их производные, аналоги и миметики. Любая аминокислота, в том числе встречающиеся в природе аминокислоты, могут быть приобретены коммерчески или синтезированы по способам, известным в данной области техники. Примеры не встречающихся в природе аминокислот включают цитруллин ("Cit"), норлейцин ("Nle"), норвалин ("Nva"), n-аланин, L- или D-нафталанин, орнитин ("Orn"), гомоаргинин (homoArg) и другие, хорошо известные в данной области техники химии пептидов, в том числе и те, которые описаны в М. Bodanzsky, "Principles of Peptide Synthesis," 1st and 2nd revised ed., Springer-Verlag, New York, N.Y., 1984 and 1993 и Stewart and Young, "Solid Phase Peptide Synthesis," 2nd ed., Pierce Chemical Co., Rockford, Ill., 1984. Обычные аминокислоты могут быть названы их полным названием, стандартным однобуквенным обозначением или стандартным трехбуквенным обозначением, например: A, Ala, аланин; С, Cys, цистеин; D, Asp, аспарагиновая; Е, Glu, глутаминовая кислота; F, Phe, фенилаланин; G, Gly, глицин; Н, His, гистидин; I, Ile изолейцин; K, Lys, лизин; L, Leu, лейцин; М, Met, метионин; N, Asn, аспарагин; Р, Pro, пролин; Q, Gln, глутамин; R, Arg, аргинин; S, Ser, серин; Т, Thr, треонин; V, Val, валин; W, Trp, триптофан; X, Hyp, гидроксипролин; Y, Tyr, тирозин. Любые и все аминокислоты в составах по данному изобретению могут быть встречающимися в природе, синтетическими и их производными или миметиками. При условии, что аминокислотные остатки содержат один или несколько хиральных центров, любой из D, L, мезо, трео или эритро (в зависимости от конкретного случая) рацематов или их смесей входит в объем данного изобретения.

Термин "другая аминокислота", как применяют в данном документе, означает, что аминокислота отличается от аминокислоты, присутствующей в этом положении в природе. Это включает, но не ограничиваясь этим, аминокислоты, которые могут быть закодированы полинуклеотидом. В некоторых вариантах реализации изобретения отличная аминокислота находится в естественной L-форме и может быть закодирована полинуклеотидом.

Термин "конструкция" предназначен для обозначения сегмента полинуклеотид, который может быть основан на в полной мере или частично встречающейся в природе нуклеотидной последовательности, кодирующей представляющий интерес полипептид. Конструкция может необязательно содержать другие полинуклеотидные сегменты. Аналогичным образом, термин "аминокислоты, которые могут быть закодированы с помощью полинуклеотидных конструкций", охватывает аминокислоты, которые могут быть закодированы с помощью полинуклеотидных конструкций, определенных выше, т.е. такие аминокислоты, как Ala, Val, Leu, Ile, Met, Phe, Trp, Pro, Gly, Ser, Thr, Cys, Tyr, Asn, Glu, Lys, Arg, His, Asp и Gln.

Термин "DBL2Xb", как применяют в данном документе, соответствует домену VAR2CSA, характеризующемуся тем, что имеет аминокислотную последовательность с по меньшей мере 70% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью, идентифицированной по 153-577 из SEQ ID NO: 1.

Термин "производное", как применяют в данном документе, предназначен для обозначения полипептида VAR2CSA, проявляющего по существу такую же или улучшенную биологическую активность по сравнению с VAR2CSA дикого типа, идентифицированному по SEQ ID NO: 55 или SEQ ID NO: 56 или их фрагменту, в котором одна или более аминокислот исходного пептида были химически модифицированы, например, алкилированием, ПЭГилированием, ацилированием, образованием сложного эфира или образованием амида или тому подобным.

"Представляющие интерес болезнь или состояние" включают заболевания и состояния, связанные с экспрессированием, таким как аномальная экспрессия CSA, например, при раке, артрите, артрозе, рассеянном склерозе, лечении после нейронального повреждения, восстановлении хряща, заживлении ран, а также при псориазе.

"Эффективное количество" или "терапевтически эффективное количество" соответствует таковому количеству соединения, описанного в данном документе, которое, при введении млекопитающему, предпочтительно, человеку, является достаточным для осуществления лечения, как определено ниже, конкретного показания (например, рака или опухолевых клеток у млекопитающего, предпочтительно, человека). Количество соединения, описанного в данном документе, которое представляет собой "терапевтически эффективное количество", будет варьироваться в зависимости от соединения, состояния и его тяжести, способа введения, возраста млекопитающего, подлежащего лечению, но может быть определено обычным способом обычным специалистом в данной области с учетом его собственных знаний и этого раскрытия.

Фразы "функциональный вариант", "функциональный фрагмент" и "функциональные производные", как применяют в данном документе, соответствуют вариантам, фрагментам, процессированным версиям, а также производным SEQ ID NO: 55 или SEQ ID NO: 56, таким, как любая из SEQ ID NO: 1, 3-5, 10, 11, 29, 34, 36-38, 41, 43-45, 48, 53-56, полипептиды которых содержат связанные с помощью эфирной связи последовательности SEQ ID NO: 55 или SEQ ID NO: 56 и по меньшей мере обладают способностью связывать plCSA. Соответственно, такие полипептиды представляют собой полипептиды VAR2CSA, как применяют в данном документе. Следует понимать, что функциональный вариант VAR2CSA или функциональный фрагмент могут иметь два или три признака, выбранных из того, они являются и вариантом и/или фрагментом и/или производным. Функциональный вариант или фрагмент полипептида VAR2CSA включают те, которые проявляют по меньшей мере около 25%, например, по меньшей мере около 50%, например, по меньшей мере около 75%, например, по меньшей мере около 90% аффинности связывания полипептида VAR2CSA дикого типа, который был получен в клетках того же типа в анализах при исследовании, как описано в данном документе или в WO 2013/117705.

Термин "иммунологический фрагмент", как применяют в данном документе, соответствует фрагменту аминокислотной последовательности, который обладает в основном теми же функциональными активностями и той же пространственной ориентацией, для того, чтобы быть распознанным нацеливающей функциональной группой. Соответственно, специфическая нацеливающая функциональная группа будет связывать как полипептид, так и иммунологические фрагменты.

Термин "внутриклеточный метаболит" соответствует соединению, получаемому в результате метаболического процесса или реакции внутри клетки на соединение, описанное в данном документе (например, конъюгат VAR2CSA-лекарственное средство). Метаболический процесс или реакция могут быть ферментативным способом, таким как протеолитическое расщепление пептидного линкера заявленного соединения или гидролиз функциональной группы, такой как гидразон, сложный эфир или амид в пределах заявленного соединения, или деградацией части или всей нацеливающей функциональной группы. В контексте конъюгатов, внутриклеточные метаболиты могут включать, но без ограничения этим, полипептиды VAR2CSA и свободное лекарственное средство, которые могут быть разделены внутриклеточно, т.е., после ввода, диффузии, поглощения или транспорта в клетку (например, путем ферментативного расщепления конъюгата внутриклеточным ферментом или деградации полипептида VAR2CSA).

В контексте конъюгатов, термины "расщепленный внутриклеточно" и "внутриклеточное расщепление" относятся к метаболическим процессам или реакциям внутри клетки на соединение, описанное в данном документе, посредством чего ковалентное присоединение, например, линкер между несущей полезную нагрузку и нацеливающей функциональной группой разрушается, в результате чего свободное лекарственное средство диссоциирует от функциональной группы внутри клетки. В некоторых вариантах реализации изобретения отщепленные функциональные группы заявленных соединений являются внутриклеточными метаболитами. Соответственно, в одном варианте реализации изобретение предлагает соединения, которые являются продуктами расщепления соединения Формулы I, чьи продукты расщепления включают соединения Формулы II. В качестве альтернативы, лекарственное средство может быть освобождено посредством деградации или протеолиза полипептида VAR2CSA.

Термин "внеклеточное расщепление" относится к метаболическому процессу или реакции вне клетки на соединение, описанное в данном документе, посредством чего ковалентное присоединение, например, линкер между несущей полезную нагрузку и нацеливающей функциональной группой разрушается, в результате чего свободное лекарственное средство диссоциирует от функциональной группы вне клетки. В некоторых вариантах реализации изобретения отщепленные функциональные группы заявленных соединений изначально представляют собой внеклеточные метаболиты, которые могут перемещаться внутрь клетки с помощью диффузии и проницаемости клеток или транспортировки.

Термин "выделенный полипептид" соответствует полипептиду, описанному в данном документе, который (1) был отделен от по меньшей мере около 50 процентов полинуклеотидов, липидов, углеводов или других материалов (т.е., загрязняющих примесей), с которыми он связан в природе (не включая посттрансляционные модификации). Предпочтительно, выделенный полипептид по существу свободен от каких-либо других загрязняющих полипептидов или других загрязняющих примесей, которые находятся в своей естественной среде, которая будет мешать его терапевтическому, диагностическому, профилактическому или исследовательскому применению.

Термин "ID1", как применяют в данном документе, соответствует домену VAR2CSA, характеризующемуся тем, что имеет аминокислотную последовательность с по меньшей мере 70% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью, идентифицированной по 1-152 из SEQ ID NO: 1.

Термин "ID2a", как применяют в данном документе, соответствует домену VAR2CSA, характеризующемуся тем, что имеет аминокислотную последовательность с по меньшей мере 20, по меньшей мере 21, по меньшей мере 22, по меньшей мере 23, по меньшей мере 24, по меньшей мере 25, по меньшей мере 26, по меньшей мере 27, по меньшей мере 28, по меньшей мере 29, по меньшей мере 30, по меньшей мере 31, по меньшей мере 32, по меньшей мере 33, по меньшей мере 34, по меньшей мере 35, по меньшей мере 36, по меньшей мере 37, по меньшей мере 38, по меньшей мере 39, по меньшей мере 40, по меньшей мере 41, по меньшей мере 42, по меньшей мере 43, по меньшей мере 44, по меньшей мере 45, по меньшей мере 46, по меньшей мере 47, по меньшей мере 48, по меньшей мере 49, по меньшей мере 50, по меньшей мере 51, по меньшей мере 52, по меньшей мере 53, по меньшей мере 54, по меньшей мере 55, по меньшей мере 56, по меньшей мере 57, по меньшей мере 58, по меньшей мере 59, по меньшей мере 60, по меньшей мере 61 или по меньшей мере 62, например, 63 последовательных аминокислот от N-конца аминокислот 578-640 из SEQ ID NO: 1 и с по меньшей мере 70% идентичности последовательности по отношению к такой последовательности последовательных аминокислот. В некоторых вариантах реализации изобретения идентичность аминокислотной последовательности, упоминаемой в данном документе, с по меньшей мере 70% любой последовательности, идентифицированной с помощью SEQ ID NO: 1-57 или ее фрагмента, соответствует последовательности с по меньшей мере 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 8, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичности последовательности по отношению к этой последовательности.

"Млекопитающее" включает людей и как домашних животных, таких как лабораторные животные, так и одомашненных животных (например, кошек, собак, свиней, крупный рогатый скот, овец, коз, лошадей, кроликов) и промысловых животных, таких как дикие животные и подобное.

Термин "микроорганизм", как применяют в данном документе, соответствует бактериям, грибам, археям, протистам (таким как зеленые водоросли и планктон), планариям и амебам. В пределах этого определения лежат патогенные микроорганизмы.

Полипептид с "нативной последовательностью" представляет собой тот, который имеет ту же самую аминокислотную последовательность, что и полипептид, полученный из природы. Такие полипептиды с нативной последовательностью могут быть выделены из природных источников или могут быть получены с помощью рекомбинантных или синтетических способов. Таким образом, полипептид с нативной последовательностью может иметь аминокислотную последовательность встречающегося в природе полипептида человека, полипептида мыши или полипептида от любых других видов млекопитающих.

"Необязательный" или "необязательно" означает, что впоследствии описанное событие обстоятельств может произойти или может не произойти, и что описание включает случаи, когда указанное событие или обстоятельство имеет место, и случаи, в которых его нет. Например, "необязательно замещенного арил" означает, что арильный заместитель может быть замещен или может не быть замещен, и что описание включает как замещенные арильные заместители, так и арильные заместители, не имеющие замещения.

"Фармацевтическая композиция" соответствует составу соединения по данному описанию и среде, которая, как правило, является приемлемой в данной области техники для доставки биологически активного соединение млекопитающим, например, людям. Подобная среда включает все фармацевтически приемлемые для этого носители, разбавители или вспомогательные средства.

"Фармацевтически приемлемый носитель, разбавитель или вспомогательное вещество" включает, без ограничения, любой адъювант, носитель, вспомогательное вещество, вещество, способствующее скольжению, подсластитель разбавитель, консервант, краситель/красящее вещество, усилитель вкуса, поверхностно-активное вещество, смачивающее средство, диспергирующее средство, суспендирующее средство, стабилизатор, изотоническое средство, растворитель или эмульгатор, который был одобрен United States Food and Drug Administration как приемлемый для применения на людях или домашних животных.

"Фармацевтически приемлемая соль" включает соли присоединения как кислоты, так и основания. "Фармацевтически приемлемая соль присоединения кислоты" соответствует тем солям, которые сохраняют биологическую эффективность и свойства свободных оснований, которые не являются биологически или иным образом нежелательными, и которые образованы с помощью неорганических кислот, таких как, но не ограничиваясь этим, хлористоводородной кислоты, бромистоводородной кислоты, серной кислоты, азотной кислоты, фосфорной кислоты и подобного, и органических кислот, таких как, но не ограничиваясь этим, уксусной кислоты, 2,2-дохлоруксусной кислоты, адипиновой кислоты, альгиновой кислоты, аскорбиновой кислоты, аспарагиновой кислоты, бензолсульфоновой кислоты, бензойной кислоты, 4-ацетамидобензойной кислоты, камфорной кислоты, камфор-10-сульфокислоты, каприновой кислоты, капроновой кислоты, каприловой кислоты, угольной кислоты, коричной кислоты, лимонной кислоты, цикламиновой кислоты, додецилсерной кислоты, этан-1,2-дисульфоновой кислоты, этансульфоновой кислоты, 2-гидроксиэтансульфоновой кислоты, муравьиной кислоты, фумаровой кислоты, галактаровой кислоты, гентизиновой кислоты, глюкогептоновой кислоты, глюконовой кислоты, глюкуроновой кислоты, глутаминовой кислоты, глутаровой кислоты, 2-оксо-глутаровой кислоты, глицерофосфорной кислоты, гликолевой кислоты, гиппуровой кислоты, изомасляной кислоты, молочной кислоты, лактобионовой кислоты, лауриновой кислоты, малеиновой кислоты, яблочной кислоты, малоновой кислоты, миндальной кислоты, метансульфоновой кислоты, муциновой кислоты, нафталин-1,5-дисульфокислоты, нафталин-2-сульфоновой кислоты, 1-гидрокси-2-нафтойной кислоты, никотиновой кислоты, олеиновой кислоты, оротовой кислоты, щавелевой кислоты, пальмитиновой кислоты, памовой кислоты, пропионовой кислоты, пироглутаминовой кислоты, пировиноградной кислоты, салициловой кислоты, 4-аминосалициловой кислоты, себациновой кислоты, стеариновой кислоты, янтарной кислоты, винной кислоты, тиоциановой кислоты, n-толуолсульфоновой кислоты, трифторуксусной кислоты, ундециленовой кислоты и подобных. "Фармацевтически приемлемая соль присоединения основания" соответствует тем солям, которые сохраняют биологическую эффективность и свойства свободных кислот, которые не являются биологически или иным образом нежелательными. Эти соли получают добавлением неорганического основания или органического основания к свободной кислоте. Соли, полученные из неорганических оснований, включают, но не ограничиваясь этим, соли натрия, калия, лития, аммония, кальция, магния, железа, цинка, меди, марганца, алюминия и подобное. Предпочтительными неорганическими солями являются соли аммония, натрия, калия, кальция и магния. Соли, полученные из органических оснований, включают, но не ограничиваясь этим, соли первичных, вторичных и третичных аминов, замещенных аминов, в том числе встречающихся в природе замещенных аминов, циклических аминов и катионобменных смол, таких как аммоний, изопропиламин, триметиламин, диэтиламин, триэтиламин, трипропиламин, диэтаноламин, этаноламин, динол, 2-диметиламиноэтанол, 2-диэтиламиноэтанол, дициклогексиламин, лизин, аргинин, гистидин, кофеин, прокаин, гидрабамин, холин, бетаин, бенетамин, бензатин, этилендиамин, глюкозамин, метилглюкамин, теобромин, триэтаноламин, трометамин, пурины, пиперазин, пиперидин, N-этилпиперидин, полиаминные смолы и подобное. Особенно предпочтительными органическими основаниями являются изопропиламин, диэтиламин, этаноламин, триметиламин, дициклогексиламин, холин и кофеин.

"Пролекарство", как предполагается, определяет соединение, которое может быть преобразовано в биологически активное соединение в физиологических условиях или с помощью сольволиза. Таким образом, термин "пролекарство" соответствует метаболическому прекурсору соединения по описанию, который является фармацевтически приемлемым. Пролекарство может быть активным или неактивным, когда его вводят субъекту, нуждающемуся в этом, но in vivo преобразуется в активное соединение по описанию. Пролекарства, как правило, быстро трансформируются in vivo с получением исходного соединения, например, с помощью гидролиза в крови. Пролекарственное соединение часто дает преимущества растворимости, тканевой совместимости или замедленного высвобождения в организме млекопитающих (смотри, Bundgard, Н., Design of Prodrugs (1985), pp. 7-9, 21-24 (Elsevier, Amsterdam)). Обсуждение пролекарств приведено у Higuchi, Т., et al., A.C.S. Symposium Series, Vol. 14 и в Bioreversible Carriers in Drug Design, Ed. Edward B. Roche, American Pharmaceutical Association and Pergamon Press, 1987. Пролекарства соединения по данному описанию могут быть получены путем модификации функциональных групп, присутствующих в соединении по данному описанию, таким образом, что модификации расщепляются, либо в обычной процедуре, либо in vivo, до родоначального соединения по описанию. Пролекарства включают соединения по описанию, в которых гидрокси, амино или меркапто группа связана с любой группой, которая, при условии, что пролекарство соединения по описанию вводят субъекту, относящемуся к млекопитающим, расщепляется с образованием свободной гидрокси, свободной амино или свободной меркаптогруппы, соответственно. Примеры пролекарств включают, но без ограничения этим, ацетатные, формиатные и бензоатные производные спирта или амидные производные амина функциональных групп в соединениях по данному описанию и тому подобное.

Термин "защитная группа", как применяют в данном документе, соответствует лабильной химической функциональной группе, которая известна в данной области техники для защиты реакционноспособных групп, в том числе, без ограничения, гидроксильных и амино групп, от нежелательных реакций в процессе синтеза. Гидроксильные и амино группы, которые защищены защитной группой, упоминаются в данном документе как "защищенные гидроксильные группы" и "защищенные амино группы", соответственно. Защитные группы обычно применяют избирательно и/или независимо друг от друга для защиты сайтов во время реакций на других реакционноспособных сайтах, а затем могут быть удалены, чтобы оставить незащищенную группу как есть, или с возможностью для применения в дальнейших реакциях. Защитные группы, как известно в данной области техники, описаны, в общем, в Greene and Wuts, Protective Groups in Organic Synthesis, 3rd edition, John Wiley & Sons, New York (1999). Группы могут быть выборочно включены в соединения по данному описанию в качестве прекурсоров. Например, аминогруппа может быть помещена в соединение по данному описанию как азидогруппа, которая может быть химически преобразована в аминогруппу в нужной точке синтеза. Как правило, группы защищены или присутствуют в качестве прекурсора, который будет инертным по отношению к реакциям, которые модифицируют другие области родоначальной молекулы для конверсии в их конечные группы в соответствующее время. Дополнительно типичные защитные группы или группы-предшественники обсуждаются в Agrawal, et al., Protocols for Oligonucleotide Conjugates, Eds, Humana Press; New Jersey, 1994; Vol. 26 pp. 1-72. Примеры "гидроксильных защитных групп" включают, но без ограничения этим, трет-бутил, трет-бутоксиметил, метоксиметил, тетрагидропиранил, 1-этоксиэтил, 1-(2-хлорэтокси)этил, 2-триметилсилилэтил, n-хлорфенил, 2,4-динитрофенил, бензил, 2,6-дихлорбензил, дифенилметил, n-нитробензил, трифенилметил, триметилсилил, триэтилсилил, трет-бутилдиметилсилил, трет-бутилдифенилсилил (TBDPS), трифенилсилил, бензоилформиат, ацетат, хлорацетат, трихлорацетат, трифторацетат, пивалоат, бензоат, n-фенилбензоат, 9-флуоренилметилкарбонат, мезилат и тозилат. Примеры "аминозащитных групп" включают, но без ограничения этим, карбаматзащитные группы, такие как 2-триметилсилилэтоксикарбонил (Teoc), 1-метил-1-(4-бифенилил)этоксикарбонил (Врос), трет-бутоксикарбонил (ВОС), аллилоксик